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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004500`

染色体: Chr02 坐标: 67504236-67504990 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004500`
名称	SmilChr02G004500
描述	ethylene-responsive transcription factor ERF084
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67504236 - 67504990 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007590`
GeneID	`131007590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007590`
原始查询	`LOC131007590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor ERF084
产物	ethylene-responsive transcription factor ERF084
Arabidopsis	`AT1G80580` (AT1G80580) Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844397] identity=63.5; qcov=0.539; evalue=4.75e-28; confidence=medium
Rice	`Os04g0399800` (OsERF#082) - identity=68.6; qcov=0.363; evalue=2.92e-24; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790479.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790479.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790479.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790479.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67504295`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	B106,B119,B137,B6,B73,B78,C17,C38,C52,C56,C63,C67,C87
`Chr2:67504296`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B106,B119,B137,B6,B73,B78,C17,C38,C52,C56,C63,C67,C87
`Chr2:67504371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr2:67504372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr2:67504633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr2:67504639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:67504698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,C40,C45,C83
`Chr2:67504845`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B100,B126,B45,B47,B74,C35,C36,C38,C4,C70,C71,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790479.1

193 aa

193

AP2

PF00847 AP2 62-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790479.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	62	111	7.1e-15	55.8	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934496.1
AAAACCCGCAGCACAGCAGCAGTCTTGGGGAAATGTTGAGAAACGACTCTTTGTTTCCTAAAGTAGAGAAAGAAAAGGCTGAGATGCTTCACTTGTATTTCCGCCAAAACCCTCCCGCTCTCGAAGGGATCGCCGCCGTTGTCGGCGAACGCGTCCTCTTCGGCGCCGCAGATGAAACCGGAGAAAAACCGGTTGTTGATAGCGCGGTGCAGAAGAGCTACAGGGGCGTCAGGAAGCGGCCGTGGGGGCGGTGGTCGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007590
ATGTTGAGAAACGACTCTTTGTTTCCTAAAGTAGAGAAAGAAAAGGCTGAGATGCTTCACTTGTATTTCCGCCAAAACCCTCCCGCTCTCGAAGGGATCGCCGCCGTTGTCGGCGAACGCGTCCTCTTCGGCGCCGCAGATGAAACCGGAGAAAAACCGGTTGTTGATAGCGCGGTGCAGAAGAGCTACAGGGGCGTCAGGAAGCGGCCGTGGGGGCGGTGGTCGGCTGAGATACGCGACCGCATAGGGCGGTGCCGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790479.1
MLRNDSLFPKVEKEKAEMLHLYFRQNPPALEGIAAVVGERVLFGAADETGEKPVVDSAVQKSYRGVRKRPWGRWSAEIRDRIGRCRHWLGTFDTAEDAARAYDAAARRLRGSKARTNFHIPSVLPPPSSSSSNSSSSERRKRKRVSGGGTARKCSVVTSAANLFGRDPADDGGGRAVSLELDLKIDDGGLVEY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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