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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002253`

染色体: Chr02 坐标: 39965687-39968945 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002253`
名称	SmilChr02G002253
描述	clathrin light chain 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39965687 - 39968945 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007600`
GeneID	`131007600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007600`
原始查询	`LOC131007600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clathrin light chain 1-like
产物	clathrin light chain 1-like
Arabidopsis	`AT2G20760` (AT2G20760) Clathrin light chain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816605] identity=50.4; qcov=1.08; evalue=4e-74; confidence=high
Rice	`Os04g0679100` - identity=62.7; qcov=0.705; evalue=1.74e-57; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030130 (clathrin coat of trans-Golgi network vesicle); GO:0030132 (clathrin coat of coated pit); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF01086 (Clathrin_lg_ch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790489.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057790489.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790489.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790489.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790489.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39966032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,B84,C33,C47
`Chr2:39966063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D3
`Chr2:39966377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C4,C53,C84
`Chr2:39966495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,C16,C60,C61
`Chr2:39966572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C62
`Chr2:39968450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr2:39968521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,B84,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790489.1

319 aa

160

319

Clathrin_lg_ch

PF01086 Clathrin_lg_ch 108-247 aa

XP_057790490.1

319 aa

160

319

Clathrin_lg_ch

PF01086 Clathrin_lg_ch 108-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790489.1`	Pfam	`PF01086`	Clathrin_lg_ch	Family	108	247	5.3e-08	33.8	Clathrin light chain
`XP_057790490.1`	Pfam	`PF01086`	Clathrin_lg_ch	Family	108	247	5.3e-08	33.8	Clathrin light chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934507.1
GTCATTTCAAGCTCGCACATTAAACAAATGTGTGTGTACACACACATACATATATACATATTATATGGACACAAATCAGAAACATACGGCATTCTATTTTGCAGCTAGAATAGATAGAAGCGTAAAAAAGAGCAAAGAAAATCGAAAACTTGGAGAGAGAAAATTCAGCGTCTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGGCATCCTTCGACGACGCGTCAGCTCCTCCATTTGACTACGAAGGACACACCAGCTACGCCG...

XM_057934506.1
CGCACATTAAACAAATGTGTGTGTACACACACATACATATATACATATTATATGGACACAAATCAGAAACATACGGCATTCTATTTTGCAGCTAGAATAGATAGAAGCAGAAAATTCAGCGTCTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGGCATCCTTCGACGACGCGTCAGCTCCTCCATTTGACTACGAAGGACACACCAGCTACGCCGATAACTATTCCGCCTTCTCCTCCGCCGACACTCCGCCCTATTCCGGCAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007600
ATGGCATCCTTCGACGACGCGTCAGCTCCTCCATTTGACTACGAAGGACACACCAGCTACGCCGATAACTATTCCGCCTTCTCCTCCGCCGACACTCCGCCCTATTCCGGCACTGCCTTCACGCCGGAGTATTCGGAGTCCGAGCAAGTTCCAGCAGACCAGCCCAACTCCTCCGATCCATTCGGATTTGAGTCGAATGCTGAGCCTTTCGAGCACGACGCTTCGGTTCCGATCTCGAACGGCAACGGGAGCTCGCCGTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790489.1
MASFDDASAPPFDYEGHTSYADNYSAFSSADTPPYSGTAFTPEYSESEQVPADQPNSSDPFGFESNAEPFEHDASVPISNGNGSSPYDLGQDSEGIFTSDGPILPPPNEMQEEGFALREWRRLNTIRLEEKEKREKEMRIQIIIEGEEYIKAFYEKTKLNVETNKSTNREKEKSSLASQEKFHKEADKHYWKSIAELVPNEVAQIEKRGKKKDQDKKPSITVVQGPKPGKPTDLSRMRGILVKLKHNPPPHMLPPPPPPA...

XP_057790490.1
MASFDDASAPPFDYEGHTSYADNYSAFSSADTPPYSGTAFTPEYSESEQVPADQPNSSDPFGFESNAEPFEHDASVPISNGNGSSPYDLGQDSEGIFTSDGPILPPPNEMQEEGFALREWRRLNTIRLEEKEKREKEMRIQIIIEGEEYIKAFYEKTKLNVETNKSTNREKEKSSLASQEKFHKEADKHYWKSIAELVPNEVAQIEKRGKKKDQDKKPSITVVQGPKPGKPTDLSRMRGILVKLKHNPPPHMLPPPPPPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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