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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002134`

染色体: Chr01 坐标: 37333668-37335393 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002134`
名称	SmilChr01G002134
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37333668 - 37335393 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007604`
GeneID	`131007604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007604`
原始查询	`LOC131007604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=30.3; qcov=1.01; evalue=4.7e-63; confidence=low
Rice	`Os03g0822100` - identity=31.7; qcov=1.01; evalue=6.4e-84; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790497.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790497.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790497.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790497.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37333677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr1:37333775`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A7,B111,B136,B36,C55,C6,C75,C84,C85,D9
`Chr1:37333848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr1:37333874`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A7,B103,B104,B107,B111,B112,B117,B136,B17,B36,B47,B48,B49,C2,C37,C39,C4,C42,C45,C50,C52,C55,C56,C6,C61,C7,C73,C75,C84,C85,C87,D10,D11,D9
`Chr1:37333878`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A7,B103,B104,B107,B111,B112,B117,B129,B136,B17,B36,B47,B48,B49,C2,C37,C39,C4,C42,C45,C50,C52,C55,C56,C6,C61,C7,C73,C75,C84,C85,C87,D10,D11,D9
`Chr1:37333975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr1:37334138`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A4,A8,B1,B129,C34,C37,C42,C87
`Chr1:37334249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B129
`Chr1:37334416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C16,C39,D10
`Chr1:37334416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C39,D10
`Chr1:37334480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,C16,C39,D10
`Chr1:37334531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C16,C39,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790497.1

495 aa

248

495

ZBED1_RNase-like

ZBED1_RNase-like_helical

PF27041 ZBED1_RNase-like 163-258 aa PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 262-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790497.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	163	258	3.3e-32	111.2	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057790497.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	262	370	1.1e-34	119.5	ZBED1 RNase-like helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934514.1
ATGACAAAGAAAAGAAAACGCACATCCAAAGTGTGGGATGACTTCAAAGAGATCACTGATGTGAAAGGAAATGTGAAAGCCGAATGCATTCACTGCAAGACACGGCTATCAGTCAACAAGACTGGTTGTACAACTCACTTGGCTAGACATAGTGCCAAATGCACTGCTAAACAAATTCACAGCACGAAAGGCCAACAAAATATCAGCATCACAATGTCTATGGCTCAGAAGGAAGCGGTGAGCTCTGTCACTAATTTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007604
ATGACAAAGAAAAGAAAACGCACATCCAAAGTGTGGGATGACTTCAAAGAGATCACTGATGTGAAAGGAAATGTGAAAGCCGAATGCATTCACTGCAAGACACGGCTATCAGTCAACAAGACTGGTTGTACAACTCACTTGGCTAGACATAGTGCCAAATGCACTGCTAAACAAATTCACAGCACGAAAGGCCAACAAAATATCAGCATCACAATGTCTATGGCTCAGAAGGAAGCGGTGAGCTCTGTCACTAATTTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790497.1
MTKKRKRTSKVWDDFKEITDVKGNVKAECIHCKTRLSVNKTGCTTHLARHSAKCTAKQIHSTKGQQNISITMSMAQKEAVSSVTNFKYDHSKIRDVLSHMIIVHELPFRFPEYELFNLLMKSATPLYNKISRATTKKDCWASYELEKKRLMNELKSVSRVSVTTDLWTSDQNISYMVVTGHYVDSNWNLQKRTLNFCDIPPPHTGVVISDVLQRCFREWGIEEKVWTITVDNASNNDVAIRILKENLLFRHTLPLGGQIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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