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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004505`

染色体: Chr02 坐标: 67583729-67588518 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004505`
名称	SmilChr02G004505
描述	ribonuclease 3-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67583729 - 67588518 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007605`
GeneID	`131007605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007605`
原始查询	`LOC131007605`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribonuclease 3-like protein 1
产物	ribonuclease 3-like protein 1
Arabidopsis	`AT1G80650` (RTL1) RNAse THREE-like protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844404] identity=44.7; qcov=0.547; evalue=1.13e-11; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00035 (dsrm); PF14709 (DND1_DSRM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790494.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790495.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790494.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790495.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790495.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67584224`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A3,A9,B101,B113,B114,B131,B22,B24,B35,B47,B5,B50,B73,B91,B95,B99,C23,C24,C3,C30,C87,D4
`Chr2:67584227`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A3,A9,B101,B113,B114,B131,B22,B24,B35,B47,B5,B50,B73,B91,B95,B99,C23,C24,C3,C30,C87,D4
`Chr2:67584231`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A3,A9,B101,B113,B114,B131,B22,B24,B35,B47,B5,B50,B73,B91,B95,B99,C23,C24,C3,C87,D4
`Chr2:67584238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,C23,C87,D4
`Chr2:67584294`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A3,B35
`Chr2:67584294`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A3,B35
`Chr2:67588103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr2:67588128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790494.1

117 aa

117

DND1_DSRM

dsrm

PF14709 DND1_DSRM 37-111 aa PF00035 dsrm 39-104 aa

XP_057790495.1

86 aa

DND1_DSRM

PF14709 DND1_DSRM 37-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790494.1`	Pfam	`PF14709`	DND1_DSRM	Domain	37	111	5.3e-16	59.4	double strand RNA binding domain from DEAD END PROTEIN 1
`XP_057790494.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	39	104	1.1e-07	33.0	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057790495.1`	Pfam	`PF14709`	DND1_DSRM	Domain	37	69	1.7e-06	28.9	double strand RNA binding domain from DEAD END PROTEIN 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934511.1
GGCAACAAAATATTTTGTAGTGATTCCGGCAACAAAAGTAGAGTATTAATAAAAATATTTTTGATATTTAATTAAATTAAAGTTGAGAATAATTTAGAACCAGATAAATAATTTAAAATTTAATCTAATAATTACCCCTAATCAAAGTGAATACCCGTGACACAAATCTAGTATACGGAGACGATAAAATAGGTGTGCTACTTTGTAAGCAGCAAACAAAGTATTCTCTCATAAAAATACGATGCTGCGCCAAGAGTGGA...

XM_057934512.1
AAATCTAGTATACGGAGACGATAAAATAGGTGTGCTACTTTGTAAGCAGCAAACAAAGTATTCTCTCATAAAAATACGATGCTGCGCCAAGAGTGGAGAAGCCCCGACCCCAACTTCTCCAACCCAACACCTATTTCTGCTGCTTTTGTTGACTCAATCACTCAACCAGATTGTGAAAGGAAGGGGTCGGCGAAGGCGTATCTGCATCACCTGTGCTCTGCAAAACAATGGAAACAGCCTCTCTTTGAATGCTGTAATGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007605
ATGCTGCGCCAAGAGTGGAGAAGCCCCGACCCCAACTTCTCCAACCCAACACCTATTTCTGCTGCTTTTGTTGACTCAATCACTCAACCAGATTGTGAAAGGAAGGGGTCGGCGAAGGCGTATCTGCATCACCTGTGCTCTGCAAAACAATGGAAACAGCCTCTCTTTGAATGCTGTAATGAAGAAGGTCCCGCTCATAAGAAACTGTTCATCTTCAAGGTCAGCATTCACTCAGAAGAAGGGCGTGTGATCGTGGAGAG...

LOC131007605
ATGCTGCGCCAAGAGTGGAGAAGCCCCGACCCCAACTTCTCCAACCCAACACCTATTTCTGCTGCTTTTGTTGACTCAATCACTCAACCAGATTGTGAAAGGAAGGGGTCGGCGAAGGCGTATCTGCATCACCTGTGCTCTGCAAAACAATGGAAACAGCCTCTCTTTGAATGCTGTAATGAAGAAGGTCCCGCTCATAAGAAACTATCTGCAATAGGTTCATCTTCAAGGTCAGCATTCACTCAGAAGAAGGGCGTGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790494.1
MLRQEWRSPDPNFSNPTPISAAFVDSITQPDCERKGSAKAYLHHLCSAKQWKQPLFECCNEEGPAHKKLFIFKVSIHSEEGRVIVESFGNTQTSKKAAAEDAAEGALWCLKHMGISW

XP_057790495.1
MLRQEWRSPDPNFSNPTPISAAFVDSITQPDCERKGSAKAYLHHLCSAKQWKQPLFECCNEEGPAHKKLSAIGSSSRSAFTQKKGV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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