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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001519`

染色体: Chr02 坐标: 28309806-28315279 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001519`
名称	SmilChr02G001519
描述	ABC1 family protein YPL109C, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28309806 - 28315279 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007678`
GeneID	`131007678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007678`
原始查询	`LOC131007678`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC1 family protein YPL109C, mitochondrial-like
产物	ABC1 family protein YPL109C%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G11390` (AT1G11390) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837681] identity=61; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0660200` - identity=63.4; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03109 (ABC1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790594.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057790594.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057790594.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790594.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790594.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28310454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:28310492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C42,C82
`Chr2:28310502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:28313690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790594.1

626 aa

313

626

ABC1

PF03109 ABC1 252-516 aa

XP_057790595.1

626 aa

313

626

ABC1

PF03109 ABC1 252-516 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790594.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	252	516	9.9e-48	163.1	ABC1 atypical kinase-like domain
`XP_057790595.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	252	516	9.9e-48	163.1	ABC1 atypical kinase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934612.1
AAGAAATTAGTAGGACCATTGTTTGAGAAACAGGTCTGGTATACTTTCCCTAATTAAAATGGAATATCAGCAGTCCTCATTCACTCCAATGCCCTCAATTCAGCTGATCCGCAAACCAAATGTCTCTTAAATTCCACTTGCCTCATCTCCACCCGGAATTACGCCGGCGCCGATTTCATCCTGATGAATATTGACGGCAAAGTGCCTCTCTATTTCTCTCCTTCCCCCGAGCGCTCTTGATCCCCATGGCTATTTCGAGT...

XM_057934611.1
AAGAAATTAGTAGGACCATTGTTTGAGAAACAGGTCTGGTATACTTTCCCTAATTAAAATGGAATATCAGCAGTCCTCATTCACTCCAATGCCCTCAATTCAGCTGATCCGCAAACCAAATGTCTCTTAAATTCCACTTGCCTCATCTCCACCCGGAATTACGCCGGCGCCGATTTCATCCTGATGAATATTGACGGCAAAGTGCCTCTCTATTTCTCTCCTTCCCCCGAGCGCTCTTGATCCCCATGGCTATTTCGAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007678
ATGGCTATTTCGAGTTTGAGGCGGGTCGCAAAATGCCTTGTACCAAGTGCTAGGTCTAGGTGTTGTGAGATAACTCATTGTCTGCGAACATCCCCAGTTGGATTCTGTTATGGTACCAACAGATTTTACTCACGCTGCAATGCTCCCTGTGGAGGGTTTTCATCACATATGTTTCAAGAGATCAAATACACATTATGGAGGAATAAGGGGTACAAAAGTGTAGATTTGTCATCTGCAAGCTGCAGACTTTCATACCGTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790594.1
MAISSLRRVAKCLVPSARSRCCEITHCLRTSPVGFCYGTNRFYSRCNAPCGGFSSHMFQEIKYTLWRNKGYKSVDLSSASCRLSYRAQIAWRRLFETYSYNGPMLPPISRIARAVSLAMSRSNLVAPGILAFIIGELRWSERSLAHADCFPIKDSLYMHAQGGHVYATSFIFSLLEGLVLFLRAIYLAILFSPCMVMAPFADSLGMEFRRSWLRIVRVTLEKAGPAFIKWGQWAAARPDLFPSDLCQELAELHSKAPAHS...

XP_057790595.1
MAISSLRRVAKCLVPSARSRCCEITHCLRTSPVGFCYGTNRFYSRCNAPCGGFSSHMFQEIKYTLWRNKGYKSVDLSSASCRLSYRAQIAWRRLFETYSYNGPMLPPISRIARAVSLAMSRSNLVAPGILAFIIGELRWSERSLAHADCFPIKDSLYMHAQGGHVYATSFIFSLLEGLVLFLRAIYLAILFSPCMVMAPFADSLGMEFRRSWLRIVRVTLEKAGPAFIKWGQWAAARPDLFPSDLCQELAELHSKAPAHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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