当前解析结果
SmilChr02G001488| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001488 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001488 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001488 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 27861639 - 27865958 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007703 |
|---|---|
| GeneID | 131007703 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007703 |
| 原始查询 | LOC131007703 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007703 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057790619.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790619.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057790619.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790619.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790619.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:27861646 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 60 | A1,A21,A23,A4,B102,B108,B109,B121,B126,B139,B140,B16,B20,B3,B34,B42,B43,B45,B53,B55,B56,B57,B59,B7,B70,B71,B75,B76,B8,B91,B93,B97,B99,C14,C2,C21,C23,C24,C28,C3,C32,C33,C34,C37,C4,C40,C45,C46,C47,C49,C50,C52,C57,C59,C60,C68,C74,C9,D4,D9 |
Chr2:27861686 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A20 |
Chr2:27861774 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,A24 |
Chr2:27861861 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B2,C10,C26,C57 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。