当前解析结果
SmilChr01G000272| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000272 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000272 |
| 描述 | extensin-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 5414207 - 5415073 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007719 |
|---|---|
| GeneID | 131007719 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007719 |
| 原始查询 | LOC131007719 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | extensin-like |
| 产物 | extensin-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007719 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790646.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790646.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790646.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790646.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790646.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:5414218 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | B125,B38,B39,B7,B95,B97,C28,C39,C72,C76 |
Chr1:5414222 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B111,B114,B123,B127,B44,B50 |
Chr1:5414234 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 9 | B106,B126,B138,B51,B6,B95,C31,C70,C74 |
Chr1:5414236 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B138,C40 |
Chr1:5414238 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr1:5414248 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,A20,B138,B65 |
Chr1:5414273 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B114 |
Chr1:5414275 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,C16,C34 |
Chr1:5414281 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B32,B91,C48 |
Chr1:5414293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B65,D7 |
Chr1:5414294 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B111,B114,B123,B44,B50 |
Chr1:5414306 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B24,B95,C30,C77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。