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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004474`

染色体: Chr02 坐标: 67135910-67138804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004474`
名称	SmilChr02G004474
描述	probable inactive nicotinamidase At3g16190
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67135910 - 67138804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007761`
GeneID	`131007761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007761`
原始查询	`LOC131007761`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive nicotinamidase At3g16190
产物	probable inactive nicotinamidase At3g16190
Arabidopsis	`AT3G16190` (AT3G16190) Isochorismatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820865] identity=69.4; qcov=0.99; evalue=1.17e-95; confidence=high
Rice	`Os02g0276400` - identity=66.5; qcov=0.965; evalue=1.77e-87; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00857 (Isochorismatase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007761

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790660.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790662.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057790662.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790660.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790660.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67136850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B104,B127,B54,D11
`Chr2:67136874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:67137761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B137
`Chr2:67137857`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	89	A2,A20,A3,A4,A5,A8,B100,B106,B107,B109,B112,B114,B115,B119,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B129,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B15,B17,B18,B21,B23,B26,B27,B32,B33,B34,B38,B39,B42,B43,B44,B49,B51,B58,B62,B67,B7,B70,B71,B72,B76,B80,B81,B85,B87,B9,B90,B91,B92,B95,C11,C17,C20,C23,C25,C26,C30,C34,C37,C39,C4,C42,C50,C51,C52,C54,C55,C58,C61,C69,C72,C75,C78,C80,C81,C86,D9
`Chr2:67138067`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	C36
`Chr2:67138067`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C36
`Chr2:67138413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B122,B13,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790660.1

230 aa

115

230

Isochorismatase

PF00857 Isochorismatase 11-136 aa PF00857 Isochorismatase 165-203 aa

XP_057790661.1

200 aa

100

200

Isochorismatase

PF00857 Isochorismatase 11-173 aa

XP_057790662.1

198 aa

198

Isochorismatase

PF00857 Isochorismatase 11-185 aa

XP_057790663.1

198 aa

198

Isochorismatase

PF00857 Isochorismatase 11-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790660.1`	Pfam	`PF00857`	Isochorismatase	Domain	11	136	3.9e-35	122.2	Isochorismatase domain
`XP_057790660.1`	Pfam	`PF00857`	Isochorismatase	Domain	165	203	3.9e-35	122.2	Isochorismatase domain
`XP_057790661.1`	Pfam	`PF00857`	Isochorismatase	Domain	11	173	6.3e-40	137.8	Isochorismatase domain
`XP_057790662.1`	Pfam	`PF00857`	Isochorismatase	Domain	11	185	2.3e-41	142.5	Isochorismatase domain
`XP_057790663.1`	Pfam	`PF00857`	Isochorismatase	Domain	11	185	2.3e-41	142.5	Isochorismatase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934677.1
AAAAGCCCATTCATCATTTTAAAAATAATCCCATGGAATGAGCCCAAACCCTTATGGAGTATCTGTTTCTTCTCAATAGCTCCCCATTCTTTCGAGTTTCGATCCCTCCCCTATCTCTCTGTGAATCTCGCGTTTATTCTCTCTCTCTTCGGCGGCAGCAACAGTCACAGGTAGCCACACCATCATCTCTCTAGCCTCTCGCCCTCTGTCTCACTTCTCCTTCACAAATTCTGGCGCGGCACGAATTTGCTGTTACAGTA...

XM_057934678.1
ATCATTTTAAAAATAATCCCATGGAATGAGCCCAAACCCTTATGGAGTATCTGTTTCTTCTCAATAGCTCCCCATTCTTTCGAGTTTCGATCCCTCCCCTATCTCTCTGTGAATCTCGCGTTTATTCTCTCTCTCTTCGGCGGCAGCAACAGTCACAGGTAGCCACACCATCATCTCTCTAGCCTCTCGCCCTCTGTCTCACTTCTCCTTCACAAATTCTGGCGCGGCACGAATTTGCTGTTACAGTAGCACGGCGCCGC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131007761
ATGGCTGAAGCTGAGTTGAAGTGGAAGAACACTGCCCTTCTTGTAATTGATATGCAGAAAGATTTCATTTTTCCCGGCGGTCCGGTGCATGTTAAAGGCGGCGCAGCTATTGTTCCAAATGTTGTTAAGGCTGTTGAAGAAGCTCGAAGCCGTGAAATTCCTATTATTTGGGTTGTGCGCGAGCATGATCCATTGGGGAGAGATGTAGAGTTGTTCCGCAGGCATTTCTATGCTGCTGATAAACCAAAACCGACTTCAAA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057790660.1
MAEAELKWKNTALLVIDMQKDFIFPGGPVHVKGGAAIVPNVVKAVEEARSREIPIIWVVREHDPLGRDVELFRRHFYAADKPKPTSKGSVGAELVDGLVIKNGDYKLVKTRFSAFFNTHLHSYLQGAGINKLVVTGNIMLRLFFFWSMVSVIYDSMLLICLIPYSGVQTPNCIRQTVFDAVALDYHKVTVIVDATAAATPDVHIGKSSKTILNCFLGCYEKCVPFAFGLF

XP_057790661.1
MAEAELKWKNTALLVIDMQKDFIFPGGPVHVKGGAAIVPNVVKAVEEARSREIPIIWVVREHDPLGRDVELFRRHFYAADKPKPTSKGSVGAELVDGLVIKNGDYKLVKTRFSAFFNTHLHSYLQGAGINKLVVTGVQTPNCIRQTVFDAVALDYHKVTVIVDATAAATPDVHIGKSSKTILNCFLGCYEKCVPFAFGLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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