当前解析结果
SmilChr01G002184| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002184 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002184 |
| 描述 | uncharacterized protein At4g04775 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 37965046 - 37965531 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007778 |
|---|---|
| GeneID | 131007778 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007778 |
| 原始查询 | LOC131007778 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007778 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057790681.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057790681.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790681.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057790681.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790681.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:37965058 |
CCA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B41,B44,C34,C40,C47,C51 |
Chr1:37965092 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | A1,B27,B58,C17 |
Chr1:37965092 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | A1,B27,B58,C17 |
Chr1:37965127 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,A21,B46 |
Chr1:37965137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C8,D4 |
Chr1:37965138 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B51,C18 |
Chr1:37965156 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,A14,B51 |
Chr1:37965163 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B132,B50 |
Chr1:37965168 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A13,A24,B1,B25,B62,B68,B7,C40,C79,C82,D1 |
Chr1:37965177 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,B43,B82 |
Chr1:37965197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,C1,C35 |
Chr1:37965198 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C31,C49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。