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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001291`

染色体: Chr02 坐标: 23726053-23730432 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001291`
名称	SmilChr02G001291
描述	transcription factor ILR3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	23726053 - 23730432 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007779`
GeneID	`131007779`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007779`
原始查询	`LOC131007779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor ILR3
产物	transcription factor ILR3
Arabidopsis	`AT5G54680` (ILR3) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835557] identity=74.8; qcov=1.01; evalue=1.14e-123; confidence=high
Rice	`Os07g0543000` (OsbHLH057) - identity=61; qcov=0.847; evalue=3.17e-74; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007779

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790679.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790679.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790679.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790679.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:23726239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C48,D8
`Chr2:23726368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr2:23726673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:23729969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790679.1

236 aa

118

236

bHLH_IRO3

HLH

PF23177 bHLH_IRO3 76-164 aa PF00010 HLH 78-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790679.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	76	164	3e-43	146.8	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain
`XP_057790679.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	78	126	7.4e-11	42.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934696.1
GGAAGGAGTATATTTTTTGACTAAAGAAAGTTGAGGCCCAATTGGTAAATTGGGCTTATTGACTTTGAAGGCAGTTGATGTGTGCCGATAATAGTGCGTCACATAGTCGCGTGTCTGTGTGGGGAATCTTTCCTTTTAATTTTTAATTTAATTTATTTTCACGCCCAAATCCCATTTGCATCAAAAAACCCACAATTCTAATCCGAATAATTCACGACAAATAATAAGAAAATGGCCCTCCAGATTCCCCTTCACCCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007779
ATGGTTTCGCCTGAGAACACGAATTGGCTCTACGATTATGGCTTCGAGGATATCACTGTTCCAGATGCCAATTTCGCGGCTCCCAATTCCGGCTTTTCTTGGCCTGTTCAAGCCCTGACTGGCTCGACCAATGCCAGTGTCGAAATTGATGGATCATTTGGAGAATCTGATTCGCAGAAGGAAACTGGGTCCAAAAAAAGAGCTAGAACTGAGACATGTGCTATATCAAGCTCTAAAGCATGCAGGGAGAAACAACGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790679.1
MVSPENTNWLYDYGFEDITVPDANFAAPNSGFSWPVQALTGSTNASVEIDGSFGESDSQKETGSKKRARTETCAISSSKACREKQRRDRLNDKFMELGALLEPGRPPKTDKAAILVDAVRMVTQLRSEAQKLKDSNSNLQEKIKELKTEKNELRDEKQRLKAEKEKLEQQLKTMSAPQPGFLPATPNIPAAFAAQSQAGGNKLVPIISYPGVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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