当前解析结果
SmilChr02G001309| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001309 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001309 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001309 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 24321846 - 24335591 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007790 |
|---|---|
| GeneID | 131007790 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007790 |
| 原始查询 | LOC131007790 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007790 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057790690.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057790690.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790690.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790690.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790690.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:24332330 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:24332347 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:24332362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B107,B72,C56,C65 |
Chr2:24332381 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C49 |
Chr2:24332381 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr2:24332382 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 5 | A23,B107,B72,C56,C65 |
Chr2:24332382 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 5 | A23,B107,B72,C56,C65 |
Chr2:24332392 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B107,B72,C56,C65 |
Chr2:24332394 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A2,B117,B122,B132,B94,B95,C16,C61,D7 |
Chr2:24332403 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B53,C5,D8 |
Chr2:24332403 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B53,C5,D8 |
Chr2:24332407 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
7 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。