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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001327`

染色体: Chr02 坐标: 24738717-24741860 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001327`
名称	SmilChr02G001327
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24738717 - 24741860 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007800`
GeneID	`131007800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007800`
原始查询	`LOC131007800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.1; qcov=0.71; evalue=1.73e-59; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=28.9; qcov=0.736; evalue=4.52e-64; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790698.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790698.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790698.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790698.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24739125`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A14,A24,B28,B46,B50,B58,B90,B92,C31,D3
`Chr2:24739128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:24739170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C50
`Chr2:24739170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr2:24739203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B62,C65
`Chr2:24739212`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A1,A11,B129,B6,C22,C63,C67
`Chr2:24739649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C20,C41
`Chr2:24739658`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A15,A6,B108,B126,B132,B134,B27,B29,B34,B46,B66,B73,C12,C15,C23,C34,C50,C60,C7,D9
`Chr2:24739670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:24739680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B9,C22,C25,D4
`Chr2:24739737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B31,B97,C52,C70
`Chr2:24739760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B115,B97,C52,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790698.1

707 aa

354

707

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 369-463 aa PF00872 Transposase_mut 387-466 aa PF04434 SWIM 612-643 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790698.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	369	463	1.2e-21	77.6	MULE transposase domain
`XP_057790698.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	387	466	4.8e-09	36.3	Transposase, Mutator family
`XP_057790698.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	612	643	2.3e-09	37.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934715.1
CATGGGTAGATAACAAATATGAAGGTGGGGAAAGAAGATTTGCGCTTGTCCCAACGAATGGTTATACATACGATACTCTTATGAGGCAGATTGAATGTATTGTTCGTGCAGACAGGAATACATATGATTATGTATTGAACTCTTTGGTTGAGTCTTCTGAAGGGGAACTCATAATGAACATATCCAATGATGATGATGTGAAGTTTATAATGGATGCAAATGAAGTTCCTAAATTCTCTATCATTATTACTCCTAAATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007800
ATGGAACAACCTGTGTCGAATCTTGGTTTCGTGCATTTATTAAATGCTCAAAATGTTGCATCACAATTGCATGCAAATGTGATGCCTCACGTTGCTCACAACGTCAATGTGGCACAAGGTCATATTCTAAGTGACACTGTGAATATAGAGTCAGAGAATGAAAGGAGTAATGAATGGATTTATGACAATGATGATGTTGCTGAAGATGATGATGGGGACGACGTGGATACTGATTATGATGTTGGGGACGATGTGGATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790698.1
MEQPVSNLGFVHLLNAQNVASQLHANVMPHVAHNVNVAQGHILSDTVNIESENERSNEWIYDNDDVAEDDDGDDVDTDYDVGDDVDIDYDDGDDVDSLDEDNDDVVEDVVHAMSNRHTVQPLGSSSVSDIVEGDDLQYHSTRGRQWVIPGAVYQDTFSCDNVGVTDLYRREALSPGCTYADKEKLQIALGLYHLNNRVDYVVERSNKKRFAAVCRDKEKCTFLMRATSVGTGSVWRVSKWNAPHTCEMDLRKHGRRTVGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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