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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002196`

染色体: Chr01 坐标: 38110169-38112142 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002196`
名称	SmilChr01G002196
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38110169 - 38112142 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007812`
GeneID	`131007812`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007812`
原始查询	`LOC131007812`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=37.8; qcov=0.721; evalue=1.04e-23; confidence=medium
Rice	`Os06g0484800` - identity=25.2; qcov=0.721; evalue=9.58e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007812

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790714.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790714.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790714.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790714.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38110186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C51
`Chr1:38110226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:38111787`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B109
`Chr1:38111787`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B109
`Chr1:38111831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A21,A24,A7,A9,B105,B110,B119,B122,B123,B14,B18,B30,B31,B34,B37,B42,B43,B46,B61,B62,B65,B70,B74,B84,B88,B89,B95,C10,C15,C19,C26,C28,C34,C43,C5,C50,C51,C52,C57,C64,C65,C66,C70,C76,C83,C9
`Chr1:38111832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A20,B100,B125,B26,B68,B72,B90,B92,C20
`Chr1:38111939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:38111941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:38111954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr1:38111956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C85
`Chr1:38111972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B38,B39,C23
`Chr1:38111989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934731.1
ATGGCATGCTTTCGCATTCTTGTCAAAATTCGCGCCGATATTGAGAAAGCCTGTGGAGACTTTTGGTGGGAAAAAAGTGATCATGGGAAACATATGCACTGGGCTAAGTGGGATAAGCTTTGCCAGCCAAAATCTAGAACAGATCTCGGATTTCGCAAGTTACTCTCCTTCAATCAAGCTCTTCTTGCCAAACAAGTTTGGCGCTTGATTGAGAAGTCGGATTCCTTACTTGGGAGGGTGTTAATGCATAAACATTTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007812
ATGGCATGCTTTCGCATTCTTGTCAAAATTCGCGCCGATATTGAGAAAGCCTGTGGAGACTTTTGGTGGGAAAAAAGTGATCATGGGAAACATATGCACTGGGCTAAGTGGGATAAGCTTTGCCAGCCAAAATCTAGAACAGATCTCGGATTTCGCAAGTTACTCTCCTTCAATCAAGCTCTTCTTGCCAAACAAGTTTGGCGCTTGATTGAGAAGTCGGATTCCTTACTTGGGAGGGTGTTAATGCATAAACATTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790714.1
MACFRILVKIRADIEKACGDFWWEKSDHGKHMHWAKWDKLCQPKSRTDLGFRKLLSFNQALLAKQVWRLIEKSDSLLGRVLMHKHFRDGDIMNAKVSPNCSFTWRSICGGIELLAQGIRWKDSHHGSNSLCDDLWEVFQHARKYVVLEFFHARCDANRAAHKLAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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