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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001539`

染色体: Chr02 坐标: 28659110-28661709 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001539`
名称	SmilChr02G001539
描述	myosin-2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28659110 - 28661709 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007824`
GeneID	`131007824`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007824`
原始查询	`LOC131007824`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	myosin-2-like
产物	myosin-2-like
Arabidopsis	`AT5G54280` (ATM2) myosin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835516] identity=38.3; qcov=0.516; evalue=4.54e-27; confidence=medium
Rice	`Os07g0562800` (OsMyoVIIIA) - identity=28.3; qcov=0.955; evalue=2.79e-23; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007824

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057790722.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057790722.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790722.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057790722.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28659438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B14,C43,C58
`Chr2:28659708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B46
`Chr2:28659805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B37,C63
`Chr2:28659954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:28660024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B135,D4
`Chr2:28661074`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr2:28661074`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr2:28661077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B37
`Chr2:28661133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C30
`Chr2:28661153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:28661197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:28661212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790722.1

374 aa

187

374

PF00612 IQ 142-158 aa PF00612 IQ 173-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790722.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	142	158	4.3e-11	42.3	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057790722.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	173	191	4.3e-11	42.3	IQ calmodulin-binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934739.1
AAAAATAACGTTCCACTTGTTATCCGAATGAACCCCTCCAACTAACGAATGTTGTTTATAACTAATTTTCACTTTTTTAAAAAATTTCAACGGCTATATTTCATCTTCACCCCTCCCAAATAGTTTCCGAGAAATCTTCAAAACCCCATCACTTTCCAGATTCCAAATCCCATATATACACGACACCCCTCAAAATCTCTTCTAAAACTCTGCAGAAATCTCAATACCTAATTGGTAGCCTGCTTCTGCTCTCGAATATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007824
ATGTTGGCTGTAGCGCCAAATTGTATTACTCGTAGCTCGTTGGAGGAAATGCTGGAGGCTCTTCAGCGAAGAGACGAGAGCGAGGCGCAGACGCCGCGGGATGTGCCTCCTGCGCTGCCGCGACGTGCCGTCCCTCGCTCTCGCCTCCCGTCGGCCAAGAGGCGGCTACCTGTGGCTGTGAGCTCTGAAGCTGGTGGAAGCGGGGAGAGCTCCGCATTTTGTATGAAGAATGGGAAAATGAGAGGAAATGGTTTTCGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790722.1
MLAVAPNCITRSSLEEMLEALQRRDESEAQTPRDVPPALPRRAVPRSRLPSAKRRLPVAVSSEAGGSGESSAFCMKNGKMRGNGFRDEKDREMESGEWCYGAAASDEKRVKESAHDKVLQCTTEVQKGLDDRQHLQQLNEVALTFQSYVRGEIARKEYSALLTKKNQVKLEEAAIVQLQSVIRGWLARRHFSHLQKLMQPTHGKMESGISNSKVKNLPPDMLPLIVGVLEKRVLMAEESLELKEKENATFREQLQQYEAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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