当前解析结果
SmilChr02G000221| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000221 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000221 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000221 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 2879606 - 2881676 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007832 |
|---|---|
| GeneID | 131007832 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007832 |
| 原始查询 | LOC131007832 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007832 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790731.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790731.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790731.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790731.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790731.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:2879781 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr2:2879796 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:2879799 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C32 |
Chr2:2879802 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr2:2879810 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C11,C69 |
Chr2:2879810 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr2:2879816 |
C |
CGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 36 | A21,A9,B123,B129,B138,B2,B20,B30,B39,B41,B55,B59,B71,B82,B96,B98,C1,C13,C14,C17,C22,C25,C27,C32,C41,C46,C5,C54,C57,C6,C61,C64,C68,C70,C80,D11 |
Chr2:2879825 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 43 | A9,B123,B129,B13,B133,B138,B2,B20,B27,B30,B36,B39,B41,B55,B59,B66,B79,B8,B82,B98,C1,C13,C14,C17,C20,C22,C25,C27,C32,C41,C46,C5,C54,C57,C6,C61,C62,C64,C68,C70,C72,C80,D11 |
Chr2:2879837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B67 |
Chr2:2879837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr2:2879853 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B131 |
Chr2:2879867 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B29,B32,B46,B91,B99,C36 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。