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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000240`

染色体: Chr02 坐标: 3099945-3104334 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000240`
名称	SmilChr02G000240
描述	uncharacterized SmilChr02G000240
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3099945 - 3104334 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007839`
GeneID	`131007839`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007839`
原始查询	`LOC131007839`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=38.1; qcov=0.067; evalue=6.29e-12; confidence=weak
Rice	`Os08g0202300` - identity=28.4; qcov=0.264; evalue=2.72e-27; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007839

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790737.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790737.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790737.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790737.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790737.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3099949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C9,D5
`Chr2:3099963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A19,B11,D11
`Chr2:3099963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B11,D11
`Chr2:3099985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C71
`Chr2:3100009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:3100051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C87,D5
`Chr2:3100053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A1,C87,D5
`Chr2:3100053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C87,D5
`Chr2:3100069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B68
`Chr2:3100081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C48
`Chr2:3100092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A7,A8,A9,B103,B109,B112,B132,B15,B6,B9,C1,C23,C3,C34,C37,C54,C81,C84
`Chr2:3100115`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790737.1

1253 aa

626

1253

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF17919 RT_RNaseH_2 704-801 aa PF17917 RT_RNaseH 728-831 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790737.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	704	801	8.4e-27	93.9	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057790737.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	728	831	2.7e-32	111.8	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934754.1
ATGGCCTCGAATTCTCAACAAAAGAGTGCTAGAGGAGGAAGGAGGGCAGCCGTCAATGAAGCTACGCCAAGCTATGATGTTACAAGGCAACTTGCCGAGTTGACTAGGCAAGTGGAACTTTTGAGGGTGAAAGACTCTAAATCTCAACAAGTGATGTCAGTCGAGACTTGTGGGATTTGTGGAGAATCTGGACATGGAGCAAATTTATGCCCGAAAATGGGAGAGCCTATATTTGAGGATGAGGCACAAGTTAATGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007839
ATGGCCTCGAATTCTCAACAAAAGAGTGCTAGAGGAGGAAGGAGGGCAGCCGTCAATGAAGCTACGCCAAGCTATGATGTTACAAGGCAACTTGCCGAGTTGACTAGGCAAGTGGAACTTTTGAGGGTGAAAGACTCTAAATCTCAACAAGTGATGTCAGTCGAGACTTGTGGGATTTGTGGAGAATCTGGACATGGAGCAAATTTATGCCCGAAAATGGGAGAGCCTATATTTGAGGATGAGGCACAAGTTAATGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790737.1
MASNSQQKSARGGRRAAVNEATPSYDVTRQLAELTRQVELLRVKDSKSQQVMSVETCGICGESGHGANLCPKMGEPIFEDEAQVNALQGFQPRPKLNPFAPTYNLGWRNHPNFSWRQNQGQGPSQNAQNFQQPQQPNQPQYQQQQPGFYRQQQIETQVGQIAGTVGKLDQQNTRDKLPSHSEQVHAISILRSGKVVDNKVEYPQADESSSQEAESSKSEEKNEDAKKEEEKKDNGLHKAVNPYTPPIPFPSRLRNAKQDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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