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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000268`

染色体: Chr02 坐标: 3474904-3475671 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000268`
名称	SmilChr02G000268
描述	uncharacterized SmilChr02G000268
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3474904 - 3475671 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007846`
GeneID	`131007846`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007846`
原始查询	`LOC131007846`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=36.5; qcov=0.816; evalue=4.35e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007846

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790743.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057790743.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057790743.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790743.1`
5	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057790743.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3474913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B32,B64
`Chr2:3474915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B134,B138,B84,C26
`Chr2:3474929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:3474964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A1,A14,A22,A9,B10,B105,B107,B121,B135,B136,B16,B23,B26,B44,B5,B52,B54,B67,B7,B75,B88,B95,C1,C27,C3,C35,C43,C49,C51,C63,C67,C74,C79,C87
`Chr2:3475004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:3475130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,D10
`Chr2:3475162`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A5,B107,C58
`Chr2:3475162`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A5,B107,C58
`Chr2:3475164`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A5,B107,C58
`Chr2:3475164`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A5,B107,C58
`Chr2:3475173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B32,C46,C62
`Chr2:3475174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B6,C58,C63,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790743.1

255 aa

128

255

SH3_Tf2-1

PF24626 SH3_Tf2-1 56-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790743.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	56	120	1e-21	77.5	Tf2-1-like, SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934760.1
ATGATTCCTCACTATGCAGCAGGCTCGACTAAAGTTCAAGCTCTCGATGAGCTTCTGCAGCAAAGAGATGGAGTACTTCGACGGCTGAAGGAGAACCTCCGTCAGGCACAAGCTCGGATGAAGCAACAAGCCAACCGTCATCGCCGGGACTTGGAGTTTCAGGTGGGAGATCAAGTGTTAGTGCGTTTGCAACCCTATCGGCAAACTTCAGTTCGAGGCCGCCAAGCGCCCAAATTAGTTCAACGTTACTACGGGCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007846
ATGATTCCTCACTATGCAGCAGGCTCGACTAAAGTTCAAGCTCTCGATGAGCTTCTGCAGCAAAGAGATGGAGTACTTCGACGGCTGAAGGAGAACCTCCGTCAGGCACAAGCTCGGATGAAGCAACAAGCCAACCGTCATCGCCGGGACTTGGAGTTTCAGGTGGGAGATCAAGTGTTAGTGCGTTTGCAACCCTATCGGCAAACTTCAGTTCGAGGCCGCCAAGCGCCCAAATTAGTTCAACGTTACTACGGGCCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790743.1
MIPHYAAGSTKVQALDELLQQRDGVLRRLKENLRQAQARMKQQANRHRRDLEFQVGDQVLVRLQPYRQTSVRGRQAPKLVQRYYGPFPVTERIGQVAYRLELPQSSRIHPVFHVSKLRRFIPAGTTPICSLPAESFDSRPIRQPLAICGERQVLTPAGPQRQVLVQWQGEPPENSTWEARDDMQRQFPSFNLEDKVGLEGMGNDTRQEPTAIGPEEVDKPATEVEEGPNEDSPVEDVEARRTRAPPARFKDYELY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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