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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002204`

染色体: Chr01 坐标: 38362829-38363752 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002204`
名称	SmilChr01G002204
描述	uncharacterized SmilChr01G002204
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	38362829 - 38363752 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007848`
GeneID	`131007848`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007848`
原始查询	`LOC131007848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=30.4; qcov=0.649; evalue=1.33e-14; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.9; qcov=0.803; evalue=3.44e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007848

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057790747.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790747.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057790747.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790747.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790747.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:38362834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:38362846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D1
`Chr1:38362855`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A22,A23,A3,B118,B13,B45,B56,B6,B68,B72,B88,B96,C18,C30,C4,D1,D6
`Chr1:38362961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:38362972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B22,B30,B41
`Chr1:38362972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B30,B41
`Chr1:38362995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,D1
`Chr1:38362996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,D1
`Chr1:38363012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C14,C74
`Chr1:38363022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr1:38363029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B69
`Chr1:38363049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790747.1

259 aa

130

259

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 89-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790747.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	89	182	3.5e-18	66.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934764.1
ATGGCAGCGGTTTTACTTCAGCGGGGCGGAGGGAGTTGTCACCAGGATGGTGGAAAAATATTATTGGTATCTGCCGGGGGGAGGGTGGAACATGGTTCAGAGAAAATGTGGAGATCTCGGTTGGCGAAGAATCTCGAGTGGTCCCGACCTCTCCTGGAAAGAGAACTGACTTCGGTTCATAGCTTGAAATTGGTAATTGAGAACGCCCGATTAAGAGAAGGTCAGAGGGATGGATGGCATTGGAAAGCATCCCAATGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007848
ATGGCAGCGGTTTTACTTCAGCGGGGCGGAGGGAGTTGTCACCAGGATGGTGGAAAAATATTATTGGTATCTGCCGGGGGGAGGGTGGAACATGGTTCAGAGAAAATGTGGAGATCTCGGTTGGCGAAGAATCTCGAGTGGTCCCGACCTCTCCTGGAAAGAGAACTGACTTCGGTTCATAGCTTGAAATTGGTAATTGAGAACGCCCGATTAAGAGAAGGTCAGAGGGATGGATGGCATTGGAAAGCATCCCAATGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790747.1
MAAVLLQRGGGSCHQDGGKILLVSAGGRVEHGSEKMWRSRLAKNLEWSRPLLERELTSVHSLKLVIENARLREGQRDGWHWKASQCGTYTVKSAYREICSRDPNHSPHGEEFAWLPIWKAPVPLKVITTVWRALRDRLPTCDNLVKRQLDIHGSDLICAHCNSGDESVEHIFSTCGSSAELWKGLLRWFGKESALPTKLKDHLLAFTNLGTKQDVQFLLGVWMCTIWSIWRGRNNCKFNLGTWNIDKLLKELKRGPGVG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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