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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000293`

染色体: Chr02 坐标: 3710868-3715149 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000293`
名称	SmilChr02G000293
描述	uncharacterized SmilChr02G000293
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3710868 - 3715149 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007855`
GeneID	`131007855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007855`
原始查询	`LOC131007855`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29.4; qcov=0.305; evalue=6.06e-42; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=28.6; qcov=0.581; evalue=2.03e-100; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790752.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790752.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790752.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790752.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3710894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:3710905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B54
`Chr2:3710906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B59,C62
`Chr2:3710907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:3710914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C3
`Chr2:3710929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr2:3710937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B92
`Chr2:3710955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:3710978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B18,B2,C12,C37
`Chr2:3711092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:3711095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B85
`Chr2:3711098`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A1,A3,A4,B124,B126,B127,B129,B137,B140,B29,B3,B45,B47,B55,B59,B69,B7,B72,B75,B87,B88,B89,B98,C10,C2,C20,C38,C44,C71,C72,C9,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790752.1

1329 aa

664

1329

RVT_1

zf-RVT

RVT_3

PF00078 RVT_1 372-633 aa PF13966 zf-RVT 894-969 aa PF13456 RVT_3 1107-1194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790752.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	372	633	6.6e-29	101.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057790752.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	894	969	3.4e-14	54.0	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057790752.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	1107	1194	7.2e-14	52.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934769.1
ATGGTGATTATGGGAGACTTTAATGCTGTGAAAGGAGCCCATGAGAGAGTAAGCAATCGAATGCCTGACCAGATTTCCTGCCGGGATTTTTGCTCCTTTATTGATGAGACTGGTTTCATCGAATCCTCCATTGTTGGCTTGCGGTTTACTTGGTCCGGTCGCCGTTTCATGCCGAGTCACGTGGAATCTCTCCTTGATCGTGCTCTTTATTCGGACTCCTTCTCAGATTTTTGGTTCTTGATTTATACGCAAAACCTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007855
ATGGTGATTATGGGAGACTTTAATGCTGTGAAAGGAGCCCATGAGAGAGTAAGCAATCGAATGCCTGACCAGATTTCCTGCCGGGATTTTTGCTCCTTTATTGATGAGACTGGTTTCATCGAATCCTCCATTGTTGGCTTGCGGTTTACTTGGTCCGGTCGCCGTTTCATGCCGAGTCACGTGGAATCTCTCCTTGATCGTGCTCTTTATTCGGACTCCTTCTCAGATTTTTGGTTCTTGATTTATACGCAAAACCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790752.1
MVIMGDFNAVKGAHERVSNRMPDQISCRDFCSFIDETGFIESSIVGLRFTWSGRRFMPSHVESLLDRALYSDSFSDFWFLIYTQNLARVTSDHSLIVLQCCLPPRVNRRFFRFLNMWASHPNFLNMVETSWSQDMQVLCPIYLVMAKLKRLKRDLQSWNRNTFVMVDDLVTAAQRELTDIQLNISSQGYSDELFDKEVQAQARINVALSQKSCLLQQKSRVSWLNDGDRNTAFFHASLRYKKKPSRVQSLEIDGNMVSDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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