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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000297`

染色体: Chr02 坐标: 3759534-3762688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000297`
名称	SmilChr02G000297
描述	uncharacterized SmilChr02G000297
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3759534 - 3762688 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007856`
GeneID	`131007856`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007856`
原始查询	`LOC131007856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721]; symbol=AT1G40087; hit=AT1G40087; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721]; symbol=AT1G40087; hit=AT1G40087; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=22.9; qcov=0.591; evalue=6.15e-16; confidence=weak
Rice	`Os02g0129000` - identity=23.8; qcov=0.46; evalue=2.27e-12; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007856

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790753.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790753.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790753.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790753.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790753.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3760227`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A14,C22,C52,C61,C9
`Chr2:3760227`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A14,C22,C52,C61,C9
`Chr2:3760376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:3760404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:3760460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,C53,C57,C61
`Chr2:3760552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr2:3760620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A13,B126,B37,B90,C38,C57
`Chr2:3760634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:3760863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B57,C24,C60
`Chr2:3760895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:3761312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:3761511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790753.1

656 aa

328

656

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 402-529 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790753.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	402	529	2.6e-23	83.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934770.1
ATGATACATGCTGCATTAGGAAATGATTTAGGAGGAGATTCAAACCATAAAATTGGTGAGTTTAGTGACGGTCAAGCCCCTGAGAATGTCGAAGGTCTTCATGCTAATATTTCTTCAAGTGAACAACATCATGAAAATAATTTTTGTGGTGTTGACGCCTCACGATATCAGAAAATACTAGCAGAATGTGATAAAGAATTGTATCCTAATTGCAAGTACTCACAACTATACTTTAACTTGACCTTGATTCACATCAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007856
ATGATACATGCTGCATTAGGAAATGATTTAGGAGGAGATTCAAACCATAAAATTGGTGAGTTTAGTGACGGTCAAGCCCCTGAGAATGTCGAAGGTCTTCATGCTAATATTTCTTCAAGTGAACAACATCATGAAAATAATTTTTGTGGTGTTGACGCCTCACGATATCAGAAAATACTAGCAGAATGTGATAAAGAATTGTATCCTAATTGCAAGTACTCACAACTATACTTTAACTTGACCTTGATTCACATCAAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790753.1
MIHAALGNDLGGDSNHKIGEFSDGQAPENVEGLHANISSSEQHHENNFCGVDASRYQKILAECDKELYPNCKYSQLYFNLTLIHIKCMGGLSNKGFTMLLEFLKDVFPFLTSLPTSVYEAKKLCNDLGLAYMKLFYKKGPPTTNCSSLPPPSSTFSQPLTIDSHHSPDSIFNHLRPPSLNSNYTRLSPLRHSPSHLHSSSETDDSESNNNDDNSHVQVSESNVLENIEIVDDKGHVKLTRMGMKASDVFKLAKGLRILVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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