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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000340`

染色体: Chr02 坐标: 4387531-4388307 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000340`
名称	SmilChr02G000340
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4387531 - 4388307 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007866`
GeneID	`131007866`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007866`
原始查询	`LOC131007866`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT2G33030` (RLP25) receptor like protein 25 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817865] identity=40.6; qcov=0.822; evalue=6.94e-45; confidence=medium
Rice	`Os12g0221700` - identity=42.3; qcov=0.853; evalue=1.08e-46; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007866

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790763.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790763.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790763.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790763.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790763.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4387540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C85,D4
`Chr2:4387730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B59,C39
`Chr2:4387783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C5
`Chr2:4387783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:4387892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:4387925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,D2
`Chr2:4387938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B81,C28,C70
`Chr2:4387996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B64,C24,D6
`Chr2:4388008`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B36,B81,C28,C70
`Chr2:4388008`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B36,B81,C28,C70
`Chr2:4388052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr2:4388057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790763.1

258 aa

129

258

LRR_1

PF00560 LRR_1 55-75 aa PF00560 LRR_1 77-98 aa PF00560 LRR_1 102-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790763.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	55	75	8.5e-15	52.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057790763.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	77	98	8.5e-15	52.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057790763.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	102	123	8.5e-15	52.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934780.1
ATGCCTCTACCTCAAAGATATTTCAAGAATTTTAGAGCAATGATGGATGTAAAGGAAAATCAAACATATGGAGAGATTAGTGGCCCATTTCAAGCTTTTCTGGAGATGACAGTCACCGTGAAAGGCCAAGATCAGTTATTGAAGAGATTGTTGGAAGCCTTTACAATCATTGACTTATCCTCCAATAAATTCTGTGGGACTATTCCACATTCCATAGGTAATCTGAATTCTTTGAGATACTTGAATTTGTCCCAAAATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007866
ATGCCTCTACCTCAAAGATATTTCAAGAATTTTAGAGCAATGATGGATGTAAAGGAAAATCAAACATATGGAGAGATTAGTGGCCCATTTCAAGCTTTTCTGGAGATGACAGTCACCGTGAAAGGCCAAGATCAGTTATTGAAGAGATTGTTGGAAGCCTTTACAATCATTGACTTATCCTCCAATAAATTCTGTGGGACTATTCCACATTCCATAGGTAATCTGAATTCTTTGAGATACTTGAATTTGTCCCAAAATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790763.1
MPLPQRYFKNFRAMMDVKENQTYGEISGPFQAFLEMTVTVKGQDQLLKRLLEAFTIIDLSSNKFCGTIPHSIGNLNSLRYLNLSQNNLMGHIPASLGNISVLESLDLSSNKLDGGIPSELTSLTFLAKLNLSMNDLVGKIPQSTQFSTFENDSYVGNLGLCGFPLTRKCNEENGQRMWPEEEEEEDDEEYGFIDGFGWRSVVMGYGCGIIVGIGIGCWIIRFGRPRWLVEFFFGVGYTYNKNKKKKTRKRATPTQRRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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