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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000354`

染色体: Chr02 坐标: 4576737-4577192 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000354`
名称	SmilChr02G000354
描述	uncharacterized SmilChr02G000354
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4576737 - 4577192 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007873`
GeneID	`131007873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007873`
原始查询	`LOC131007873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=42.4; qcov=0.656; evalue=2.75e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=52.3; qcov=1; evalue=1.38e-46; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007873

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057790770.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057790770.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790770.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790770.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790770.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4576760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:4576780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr2:4576844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B87,B89,B97,C60
`Chr2:4576854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B6,C32,C67,C68
`Chr2:4576864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B65,C48
`Chr2:4576876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:4576894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B16,B91
`Chr2:4576902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:4576914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr2:4576916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:4576918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B36,B58,C61,C86
`Chr2:4576925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790770.1

151 aa

151

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 83-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790770.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	83	151	3.1e-23	83.2	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934787.1
ATGCAGAAGGAGTTGTTCTTGCGCATCGTCAATGTTGTGCAAGGTAAAGATACTTACTTCCAGATGAGCCATGATGCACTAGGTCGGGACTCTCTCACGTCTTTGCAGAAATGCACGGAGGCTATCTGCCAATTAGTCACTGACGTCAGTGCGGATACTTTCGACGAGTATCTCAAGGTCGCTGACACGACGGGGCGTCTATTCCTAAAGAGATTCTGCAAAGCTGTCATCTGGGCTTACAGAGCCAATTATCTTCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007873
ATGCAGAAGGAGTTGTTCTTGCGCATCGTCAATGTTGTGCAAGGTAAAGATACTTACTTCCAGATGAGCCATGATGCACTAGGTCGGGACTCTCTCACGTCTTTGCAGAAATGCACGGAGGCTATCTGCCAATTAGTCACTGACGTCAGTGCGGATACTTTCGACGAGTATCTCAAGGTCGCTGACACGACGGGGCGTCTATTCCTAAAGAGATTCTGCAAAGCTGTCATCTGGGCTTACAGAGCCAATTATCTTCGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790770.1
MQKELFLRIVNVVQGKDTYFQMSHDALGRDSLTSLQKCTEAICQLVTDVSADTFDEYLKVADTTGRLFLKRFCKAVIWAYRANYLRRPTPEDVKRLLQMHEARHRFFGMLGSLDCMHWAWKNCPKAQHGAYTCGDQGEPTLILEVIASHDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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