当前解析结果
SmilChr02G000477| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000477 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000477 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 6563890 - 6564426 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007906 |
|---|---|
| GeneID | 131007906 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007906 |
| 原始查询 | LOC131007906 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=ATMG00810; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | hit=ATMG00810; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | ATMG00810- identity=42.1; qcov=1; evalue=4.5e-50; confidence=medium |
| Rice | gene-orf490 (orf490)- identity=43.9; qcov=1.01; evalue=3.57e-46; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007906 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790802.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057790802.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790802.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790802.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790802.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:6563894 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,B126 |
Chr2:6563909 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D7 |
Chr2:6563909 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr2:6563953 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B31,C67 |
Chr2:6563973 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B31 |
Chr2:6563993 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C67 |
Chr2:6564009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C54 |
Chr2:6564011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B31 |
Chr2:6564044 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B18 |
Chr2:6564055 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C28,C41 |
Chr2:6564107 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,C47,C49,C53 |
Chr2:6564182 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B110,C49,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。