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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000501`

染色体: Chr02 坐标: 6883782-6885207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000501`
名称	SmilChr02G000501
描述	uncharacterized SmilChr02G000501
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6883782 - 6885207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007913`
GeneID	`131007913`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007913`
原始查询	`LOC131007913`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=45.5; qcov=0.953; evalue=1.26e-111; confidence=high
Rice	`Os09g0290900` - identity=71.8; qcov=0.256; evalue=9.74e-53; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790808.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790808.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790808.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790808.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6883908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	B120,B123,B130,B131,B48,B68,B75,B81,B88,C16,C19,C20,C23,C42,C59,C69,C9,D10,D2
`Chr2:6883909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	64	A15,A25,A3,A4,A7,B1,B100,B11,B112,B118,B121,B13,B131,B14,B15,B16,B19,B2,B20,B24,B28,B30,B40,B41,B45,B56,B65,B66,B67,B7,B71,B75,B84,B85,B88,B89,B92,B94,C12,C16,C2,C26,C28,C3,C35,C44,C45,C46,C48,C53,C62,C64,C66,C76,C80,C81,C83,C87,D1,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr2:6883923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B140
`Chr2:6883966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:6883976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B24
`Chr2:6884000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:6884031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr2:6884033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B20,B71,C80,C86
`Chr2:6884043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B137,C58
`Chr2:6884110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B83
`Chr2:6884174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A3,B24,C78,D5
`Chr2:6884174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B24,C78,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790808.1

429 aa

214

429

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 162-258 aa PF14291 DUF4371 261-350 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 266-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790808.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	162	258	6.4e-69	232.8	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057790808.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	261	350	6.4e-69	232.8	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057790808.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	266	356	1e-09	39.0	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934825.1
ATGGCAAGTGAAACTCCTAAATCAAAAAAATCAAAAGGAATGACAAAACAACCCGATCTTCGGCAATTTATGTTCAAGAAAATGAAATCTCAAGAGAGTGAGTCTTCTTCTCCAACAGATAAGTTACCTCAAGCTCAAGAAAATGTTATAAATTTGGGTGGTTCAAGTAGTACTAGTGTGACATTAGAGGATAAGGAATTGATTTATGATGTTGAGCTTCTTCCTCATGACCTGGGAAAAAGAATTAGCATAATGGATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007913
ATGGCAAGTGAAACTCCTAAATCAAAAAAATCAAAAGGAATGACAAAACAACCCGATCTTCGGCAATTTATGTTCAAGAAAATGAAATCTCAAGAGAGTGAGTCTTCTTCTCCAACAGATAAGTTACCTCAAGCTCAAGAAAATGTTATAAATTTGGGTGGTTCAAGTAGTACTAGTGTGACATTAGAGGATAAGGAATTGATTTATGATGTTGAGCTTCTTCCTCATGACCTGGGAAAAAGAATTAGCATAATGGATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790808.1
MASETPKSKKSKGMTKQPDLRQFMFKKMKSQESESSSPTDKLPQAQENVINLGGSSSTSVTLEDKELIYDVELLPHDLGKRISIMDYPPNERDAVRRAYILKKPCQPKTHDFPRKDLGGLRRFSVSWFEKWDWLEYSIEKDAAFCFVCYLFKNEVGLNAGGDAFVNGGFKSWNKPERFLKHVGGVKSAHNLAYEKYANLRDGKKKSILISFENATDVIQREYEIRLKASISCLHFLLGQGMAFRGHRENEESLNRGNFEM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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