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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000510`

染色体: Chr02 坐标: 7047245-7048232 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000510`
名称	SmilChr02G000510
描述	uncharacterized SmilChr02G000510
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7047245 - 7048232 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007920`
GeneID	`131007920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007920`
原始查询	`LOC131007920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790815.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057790815.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790815.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790815.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790815.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7047290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B132,B15,B8,C3
`Chr2:7047292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A6,B52,B99,C55,C6,D9
`Chr2:7047297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B108,B61,C24,D5
`Chr2:7047297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B61,C24,D5
`Chr2:7047303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,C30,C41,D8
`Chr2:7047319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:7047338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B31,C51,C62
`Chr2:7047343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B86,C13,C39,C81
`Chr2:7047347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:7047390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B106,C39,D3
`Chr2:7047393`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	166	A1,A11,A13,A15,A18,A19,A22,A24,A25,A3,A4,A6,A7,B100,B101,B103,B106,B107,B109,B11,B111,B112,B114,B115,B118,B120,B122,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B134,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B26,B27,B3,B30,B32,B37,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B49,B50,B53,B54,B55,B58,B59,B6,B60,B62,B64,B65,B67,B69,B71,B72,B74,B75,B76,B78,B79,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B89,B90,B91,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C34,C38,C39,C41,C43,C44,C45,C46,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C60,C61,C63,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D7,D8
`Chr2:7047412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790815.1

239 aa

120

239

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 39-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790815.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	39	164	3.3e-10	41.0	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934832.1
AGAGTTTGCTTGGTCGCCTGAGGACGAGCTTCTGGTCAGGGCGATGTGGGAACAGAAAGCCAGCAAGAGGTACAGTGACATGATGAGTGACTACAAGAGGAAGCTCAGGGCTAGTACCGATGAAGGTCGGGAGATGGATAGACCCCTCTGGATGTCTGCCGAACTCTGGATAGGACTCCAGGCATACTGGAGTCAGGAGGCTGTTCAGGCCGTTTCCCAGCGAGCACGTGCGAACCGGATGTCTGAGCCCGATGGACCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007920
ATGTGGGAACAGAAAGCCAGCAAGAGGTACAGTGACATGATGAGTGACTACAAGAGGAAGCTCAGGGCTAGTACCGATGAAGGTCGGGAGATGGATAGACCCCTCTGGATGTCTGCCGAACTCTGGATAGGACTCCAGGCATACTGGAGTCAGGAGGCTGTTCAGGCCGTTTCCCAGCGAGCACGTGCGAACCGGATGTCTGAGCCCGATGGACCCGGTACATGGATCAGCAGGCACGTGGGAGGGTCTCAGTCCACTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790815.1
MWEQKASKRYSDMMSDYKRKLRASTDEGREMDRPLWMSAELWIGLQAYWSQEAVQAVSQRARANRMSEPDGPGTWISRHVGGSQSTRILQQSLSLETGLPPAAQNYSTFLRLHMHEDGTFLSPRDERLDAKIRRIVVETGREDRLPEIYLEVVRPDRSRLYDTGSAGRNQVSRGSTQSTCTSMMSQQLYEIRISTLEERLQAEQAAREAEREASRAEREALEQRMAQFEEFMRQSGQLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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