当前解析结果
SmilChr02G000515| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000515 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000515 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000515 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 7117693 - 7119003 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007922 |
|---|---|
| GeneID | 131007922 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007922 |
| 原始查询 | LOC131007922 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007922 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790817.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790817.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057790817.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790817.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790817.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:7118263 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D10 |
Chr2:7118263 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:7118269 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr2:7118279 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 81 | A10,A11,A14,A16,A18,A21,A24,A25,A3,B1,B102,B104,B113,B124,B126,B127,B13,B133,B14,B18,B28,B29,B30,B33,B36,B42,B43,B45,B49,B50,B51,B53,B63,B64,B66,B67,B68,B70,B75,B79,B8,B80,B81,B83,B85,B86,B88,B89,B91,C13,C15,C16,C17,C18,C21,C22,C3,C30,C31,C34,C38,C39,C42,C48,C50,C52,C57,C58,C59,C61,C62,C74,C75,C78,C81,C85,C86,D1,D3,D4,D5 |
Chr2:7118301 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B51,B67,B89 |
Chr2:7118314 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B82,C41 |
Chr2:7118318 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B111,B137,C41,C60,C8 |
Chr2:7118329 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 75 | A1,A13,A18,A19,A24,A25,A5,A7,A9,B101,B105,B108,B109,B111,B112,B117,B118,B121,B122,B130,B131,B134,B138,B140,B18,B20,B22,B24,B26,B32,B33,B4,B40,B46,B49,B50,B52,B54,B62,B74,B76,B78,B79,B82,B9,B93,B98,B99,C11,C19,C21,C23,C32,C37,C40,C41,C42,C44,C49,C5,C53,C55,C63,C68,C69,C70,C78,C8,C80,C83,D10,D2,D3,D5,D9 |
Chr2:7118337 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | D10,D9 |
Chr2:7118350 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B113,B140,B99,D7 |
Chr2:7118363 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B79,C39,C45,C74 |
Chr2:7118386 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。