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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000524`

染色体: Chr02 坐标: 7220480-7224847 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000524`
名称	SmilChr02G000524
描述	receptor kinase-like protein Xa21
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7220480 - 7224847 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007925`
GeneID	`131007925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007925`
原始查询	`LOC131007925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor kinase-like protein Xa21
产物	receptor kinase-like protein Xa21
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=34.7; qcov=1.14; evalue=1.57e-82; confidence=low
Rice	`Os11g0695000` - identity=33.3; qcov=1.16; evalue=1.17e-92; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790820.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790820.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790820.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790820.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790820.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7220559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C14
`Chr2:7220582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:7220675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B122,C60
`Chr2:7220675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C60
`Chr2:7220691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:7220786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B82
`Chr2:7220786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:7220826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr2:7220860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C5,C63,C74
`Chr2:7220870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B93
`Chr2:7220891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C70
`Chr2:7220893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790820.1

591 aa

296

591

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 66-88 aa PF00560 LRR_1 118-140 aa PF13855 LRR_8 167-226 aa PF00560 LRR_1 192-213 aa PF00560 LRR_1 215-236 aa PF00560 LRR_1 264-285 aa PF00560 LRR_1 311-333 aa PF13855 LRR_8 311-370 aa PF00560 LRR_1 335-356 aa PF00069 Pkinase 393-546 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 393-548 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	66	88	5.5e-33	106.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	118	140	5.5e-33	106.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	167	226	1.4e-26	92.8	Leucine rich repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	192	213	5.5e-33	106.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	215	236	5.5e-33	106.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	264	285	5.5e-33	106.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	311	333	5.5e-33	106.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	311	370	1.4e-26	92.8	Leucine rich repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	335	356	5.5e-33	106.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	393	546	1.9e-28	100.3	Protein kinase domain
`XP_057790820.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	393	548	9.7e-26	91.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934837.1
ATGAACAACTTGAGTGGTTTGATTCCACAAGAGCTCTTTAACATTTCAACTCTTCAGATTCTTTCTCTTAATGACAATGCTCTGTCAGGGGTTCTTCTAACCCATTTATGCCATGCCTCTCCCTTTCTTGAAGAATTGAATCTTGACGTAAATTTCATAAGTAGTGCAATACCCAATTCTATCTCTAACTATTCTCAACTCACAATTCTCTCACTTGCTGGAAACAAATTCAGTGGTTATATACCTACTCATCTTGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007925
ATGAACAACTTGAGTGGTTTGATTCCACAAGAGCTCTTTAACATTTCAACTCTTCAGATTCTTTCTCTTAATGACAATGCTCTGTCAGGGGTTCTTCTAACCCATTTATGCCATGCCTCTCCCTTTCTTGAAGAATTGAATCTTGACGTAAATTTCATAAGTAGTGCAATACCCAATTCTATCTCTAACTATTCTCAACTCACAATTCTCTCACTTGCTGGAAACAAATTCAGTGGTTATATACCTACTCATCTTGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790820.1
MNNLSGLIPQELFNISTLQILSLNDNALSGVLLTHLCHASPFLEELNLDVNFISSAIPNSISNYSQLTILSLAGNKFSGYIPTHLGNLRLLQYLFLFDNNLTQAPSSSFITSLTNCRSLTSLSIGDNPLYGVIPNSVGNLSSSFQEFYAYNCKFSGSIPVEIGNLSSLMTLALDANELSGNIPLTIKHLLDLQGLDLSDNMLGGSIPHAICDLFKLDTLHMRQNRFSGPIPKCLGNVSSLRNIFLHSNMLNSSIPSSLWG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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