当前解析结果
SmilChr02G000544| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000544 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000544 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000544 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 7500326 - 7500844 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007931 |
|---|---|
| GeneID | 131007931 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007931 |
| 原始查询 | LOC131007931 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0191000- identity=27.6; qcov=1.05; evalue=7.69e-07; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007931 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790826.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790826.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790826.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790826.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790826.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:7500329 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B31,B46,B80 |
Chr2:7500334 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C36 |
Chr2:7500351 |
GAT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B102 |
Chr2:7500351 |
GAT |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr2:7500355 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:7500362 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,B2 |
Chr2:7500374 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B34,B73,B81,B91,C58,C60 |
Chr2:7500379 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr2:7500405 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:7500427 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:7500432 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B135,B2,B99,D11 |
Chr2:7500465 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。