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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000560`

染色体: Chr02 坐标: 7881121-7884096 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000560`
名称	SmilChr02G000560
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7881121 - 7884096 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007938`
GeneID	`131007938`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007938`
原始查询	`LOC131007938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130
Arabidopsis	`AT2G19130` (AT2G19130) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816430] identity=37.4; qcov=0.872; evalue=3.31e-62; confidence=medium
Rice	`Os01g0890200` - identity=37.3; qcov=0.904; evalue=1.23e-61; confidence=medium
GO	GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00954 (S_locus_glycop); PF01453 (B_lectin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007938

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057790833.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057790833.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790833.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790833.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7881122`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	93	A19,A20,A22,A3,A4,A7,A8,B1,B10,B106,B109,B11,B110,B111,B113,B118,B120,B125,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B134,B136,B139,B14,B29,B31,B36,B38,B39,B41,B44,B47,B52,B58,B61,B63,B64,B65,B67,B7,B70,B72,B74,B8,B81,B86,B88,B89,B90,B92,B95,B97,C1,C11,C12,C14,C16,C17,C19,C21,C22,C23,C26,C28,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C46,C47,C50,C51,C59,C62,C69,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C86,C9,D6,D8
`Chr2:7881141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:7881185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,B72,C30,C40,C87
`Chr2:7881203`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr2:7881203`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr2:7881215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B72,C40,C87
`Chr2:7881236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B72,C40,C87
`Chr2:7881241`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B49,B72,C40,C87
`Chr2:7881241`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B49,B72,C40,C87
`Chr2:7881265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B72,C40
`Chr2:7881280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:7881297`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	165	A10,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A24,A3,A5,A7,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B107,B112,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B126,B127,B128,B13,B135,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B3,B30,B31,B32,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B49,B5,B52,B54,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B65,B66,B68,B69,B7,B71,B73,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C13,C15,C19,C20,C22,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C37,C38,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C70,C71,C73,C74,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C85,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790833.1

374 aa

187

374

B_lectin

S_locus_glycop

PF01453 B_lectin 104-203 aa PF00954 S_locus_glycop 235-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790833.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	104	203	1.8e-22	80.5	D-mannose binding lectin
`XP_057790833.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	235	337	2e-21	77.3	S-locus glycoprotein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934850.1
ATGGTTCTGCCGCCATCTCCCCGTCCATTTCAATCAGCGGTTCAGCGTCGTTGCTCCATTCGCGGTGCTGCTGTTGCTTCTGTGAAATCTAATACTGATGCTATGGGATTTTACATGAATGAACTGATCATGCTCTGGTACGAATGCTCGCTAGAATGTGGATTAGACACCATTTCAGCTGGCCAATCTCTGTTTCCGAACCAGACCATAATCTCCAAAGAGGGCAAGTTTGAGTTGGGCTTCTTTGATCCTGCAGGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007938
ATGGTTCTGCCGCCATCTCCCCGTCCATTTCAATCAGCGGTTCAGCGTCGTTGCTCCATTCGCGGTGCTGCTGTTGCTTCTGTGAAATCTAATACTGATGCTATGGGATTTTACATGAATGAACTGATCATGCTCTGGTACGAATGCTCGCTAGAATGTGGATTAGACACCATTTCAGCTGGCCAATCTCTGTTTCCGAACCAGACCATAATCTCCAAAGAGGGCAAGTTTGAGTTGGGCTTCTTTGATCCTGCAGGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790833.1
MVLPPSPRPFQSAVQRRCSIRGAAVASVKSNTDAMGFYMNELIMLWYECSLECGLDTISAGQSLFPNQTIISKEGKFELGFFDPAGNSTNYYIGIWYKNIPLRTVVWVLNRDLPIPHSLYNNSQLEIANGTLLLRSGLNIFLSFNQNYNATEAVILDTGNFVLRNASGILWQSFEHPTDTLLPGAKLGYRWFSDVNVKLVSWRNPNDPASGSYSFGMGPNGGSDLSIRKGTEKLWSSGPWQRGTFPLLDLRDPNNFTYLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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