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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000567`

染色体: Chr02 坐标: 7992448-7995052 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000567`
名称	SmilChr02G000567
描述	receptor kinase-like protein Xa21
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7992448 - 7995052 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007941`
GeneID	`131007941`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007941`
原始查询	`LOC131007941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor kinase-like protein Xa21
产物	receptor kinase-like protein Xa21
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=41.2; qcov=1.03; evalue=7.12e-130; confidence=medium
Rice	`Os11g0208900` - identity=43.5; qcov=0.978; evalue=3.6e-143; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007941

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790835.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790835.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790835.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790835.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7993288`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B58
`Chr2:7993288`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B58
`Chr2:7993303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:7993359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C42,C61
`Chr2:7993370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,D11
`Chr2:7993374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,C50
`Chr2:7993380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B132,B136,C50,C86
`Chr2:7993385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:7993388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:7993447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B2
`Chr2:7993549`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A14,B119,B127,B136,B61,B97,C10,C16,C17,C28,C36,C4,C43,C46
`Chr2:7993555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,C3,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790835.1

585 aa

292

585

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 30-51 aa PF13855 LRR_8 78-137 aa PF00560 LRR_1 103-124 aa PF00560 LRR_1 175-196 aa PF00560 LRR_1 201-220 aa PF00560 LRR_1 222-243 aa PF13855 LRR_8 222-281 aa PF00560 LRR_1 246-268 aa PF00069 Pkinase 389-584 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 392-582 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	30	51	1.5e-26	87.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	78	137	1.3e-19	70.4	Leucine rich repeat
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	103	124	1.5e-26	87.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	175	196	1.5e-26	87.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	201	220	1.5e-26	87.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	222	243	1.5e-26	87.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	222	281	1.3e-19	70.4	Leucine rich repeat
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	246	268	1.5e-26	87.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	389	584	2e-35	123.2	Protein kinase domain
`XP_057790835.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	392	582	6.1e-35	121.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934852.1
ATGAAGATTGCCAATCTCAAGTGTCTTACCCAGCCACCGTCCACTTCAGTATTGAGCTTCATTACTCCATTGACAAAATGCAAGTTTCTTACTTATTTGTCAGTTTCTGATAATCCTTTATATGGCGTCCTTCCAGCTGCTGTCGGGAATTTATCTTCCCTGCTTCAAGGATTCTTCGCCTCCGGCTGCAAACTCAGTGGCAGCATTCCTGTTGAAATAGGCAATCTAAGCAGCTTGGTGGAATTGAGGTTAGACGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007941
ATGAAGATTGCCAATCTCAAGTGTCTTACCCAGCCACCGTCCACTTCAGTATTGAGCTTCATTACTCCATTGACAAAATGCAAGTTTCTTACTTATTTGTCAGTTTCTGATAATCCTTTATATGGCGTCCTTCCAGCTGCTGTCGGGAATTTATCTTCCCTGCTTCAAGGATTCTTCGCCTCCGGCTGCAAACTCAGTGGCAGCATTCCTGTTGAAATAGGCAATCTAAGCAGCTTGGTGGAATTGAGGTTAGACGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790835.1
MKIANLKCLTQPPSTSVLSFITPLTKCKFLTYLSVSDNPLYGVLPAAVGNLSSLLQGFFASGCKLSGSIPVEIGNLSSLVELRLDDNGLSGNIPLTTKHLHELQGLDLSNNMLGGSIPHAICDLFSLNTLVISQNQFFGPIPKCLGNVSSLRNIFLDSNMLNSSIPSSFWSLKDLIRLDLSSNSLIGFLPQEISNLGAAIYINLSTNQLSGSIPSTIEKLQNLVNLSLANNRLEGSIPMTVKSMINLVILDLSYNNLSGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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