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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000592`

染色体: Chr02 坐标: 8471205-8480845 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000592`
名称	SmilChr02G000592
描述	uncharacterized SmilChr02G000592
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	8471205 - 8480845 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007953`
GeneID	`131007953`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007953`
原始查询	`LOC131007953`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0545250; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os09g0545250; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G20520` (AT4G20520) RNA binding / RNA-directed DNA polymerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827800] identity=43.6; qcov=0.147; evalue=2.26e-11; confidence=weak
Rice	`Os09g0545250` - identity=29.6; qcov=0.254; evalue=1.55e-12; confidence=weak
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007953

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790846.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790846.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790846.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790846.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:8471244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:8471270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C2,C81,C87
`Chr2:8471330`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	B101,B106,B117,B120,B15,B2,B78,B88,B95,B98,C1,C3,C59,C72,C76,D8
`Chr2:8471341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B102,C32,C68
`Chr2:8471341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,C32,C68
`Chr2:8471350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C72,D7
`Chr2:8471376`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B101,B120,C1,C3,C72,C76
`Chr2:8471382`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C1,C72,C76
`Chr2:8471382`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C1,C72,C76
`Chr2:8471461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B30,C33
`Chr2:8471479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:8471544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790846.1

531 aa

266

531

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 6-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790846.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	6	112	2.5e-07	31.4	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934863.1
ATGGATTGTGTTGGTAGGAGTAGAGGCATATGTATGATCTGGAGATCTTCGGCTAGCTGCAAACTCATCGGCTACTCTCAAAATCACATTGACATGCATATCTATGATGTTAATGGTGATTGGCGGCTTACGGGGTATTATGGATTTTCGGACAGAGGTCGACGTCGCGAATCGTGGAACCTTTTACTTCGCCTAGCAGCGCTCAACTCTCTCCCCTGGGTTGTAGTGGGAGACTTCAACGACCTCCTCGATCCTGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007953
ATGGATTGTGTTGGTAGGAGTAGAGGCATATGTATGATCTGGAGATCTTCGGCTAGCTGCAAACTCATCGGCTACTCTCAAAATCACATTGACATGCATATCTATGATGTTAATGGTGATTGGCGGCTTACGGGGTATTATGGATTTTCGGACAGAGGTCGACGTCGCGAATCGTGGAACCTTTTACTTCGCCTAGCAGCGCTCAACTCTCTCCCCTGGGTTGTAGTGGGAGACTTCAACGACCTCCTCGATCCTGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790846.1
MDCVGRSRGICMIWRSSASCKLIGYSQNHIDMHIYDVNGDWRLTGYYGFSDRGRRRESWNLLLRLAALNSLPWVVVGDFNDLLDPGENRGHVDHPNWLLSEFRYAVLEYGLSDISLTGYHLTPLTVSIFDHVPILLKCNGVPPSLIKQKFRFENKWCLQPDFPNIVRDCWTNLHGINVMERLTAVSESISIWATHLHRNDRLAKTRLQNQISGLQGRTDSYSINKFKKARRDLASLLLQEETHWRQRAKQHWLQEGDCIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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