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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000645`

染色体: Chr02 坐标: 9735923-9737129 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000645`
名称	SmilChr02G000645
描述	uncharacterized SmilChr02G000645
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	9735923 - 9737129 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007973`
GeneID	`131007973`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007973`
原始查询	`LOC131007973`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007973

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790863.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790863.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790863.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790863.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790863.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:9735926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	196	A1,A10,A13,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B117,B118,B12,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B25,B26,B28,B29,B30,B31,B32,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B47,B5,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B62,B63,B64,B67,B68,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B8,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C37,C4,C40,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C49,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr2:9735937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B131
`Chr2:9735980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:9735986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A16,A21,A5,B113,B21,B28,B40,C28,C30,C42,C55,C56,C65,C78,C86,D5
`Chr2:9735988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:9735992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:9735998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B65,C36,C71
`Chr2:9735999`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B82
`Chr2:9735999`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B82
`Chr2:9736002`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr2:9736002`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr2:9736003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C26,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790863.1

377 aa

188

377

rve

PF00665 rve 166-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790863.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	166	256	1.1e-17	64.8	Integrase core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934880.1
ATGCAAGAGACCGGGAAGAAGTTTGAGAAACTCAAAATACAACAACTGCCGAGGGAAGAGAACCAGAAGGCAGACCTCTTGGCCAGAGTAGCCAGCGCAATCGAACAAACTTGGAGCGAGGACATCACTTTGGTGTTCGAACCTACGAGGGAAGCGGTTGCACAAGTATACAACATTGAAACTAGGGATGATTGGAGAACTCCCATCATATACTATCTGAAGAATGGTGAACGAATGAAAGAGGATACTTCACGATACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007973
ATGCAAGAGACCGGGAAGAAGTTTGAGAAACTCAAAATACAACAACTGCCGAGGGAAGAGAACCAGAAGGCAGACCTCTTGGCCAGAGTAGCCAGCGCAATCGAACAAACTTGGAGCGAGGACATCACTTTGGTGTTCGAACCTACGAGGGAAGCGGTTGCACAAGTATACAACATTGAAACTAGGGATGATTGGAGAACTCCCATCATATACTATCTGAAGAATGGTGAACGAATGAAAGAGGATACTTCACGATACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790863.1
MQETGKKFEKLKIQQLPREENQKADLLARVASAIEQTWSEDITLVFEPTREAVAQVYNIETRDDWRTPIIYYLKNGERMKEDTSRYAKYENYCLISDQLFKRSFTHPFLKCLAHEEAQFALEEIHHGCCGNHAGYKDLTRKVIRAGFYWPGIKGLHAKLRGLSEGIDIVGKLPTAPGGKYFLIVAVDYFSKWIEAEAITKIDDSTVEKFLWKNICCRYGVPRILVSDNGTQFTSKRIEDFCSRMDVTQKFMSVAHPQAKW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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