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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000658`

染色体: Chr02 坐标: 9986786-9988057 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000658`
名称	SmilChr02G000658
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	9986786 - 9988057 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007977`
GeneID	`131007977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007977`
原始查询	`LOC131007977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=25.1; qcov=0.941; evalue=1.42e-13; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057790867.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790867.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790867.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790867.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790867.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:9986871`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D8
`Chr2:9986871`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D8
`Chr2:9986881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C79
`Chr2:9986985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B33,B46,C30,C60
`Chr2:9986999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B61,C66
`Chr2:9987031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B33,B46,C30,C60
`Chr2:9987101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C85
`Chr2:9987103`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A22,B37,B6,C33,C63,D10
`Chr2:9987183`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A15,A2,A24,A4,B100,B103,B112,B115,B120,B122,B124,B22,B27,B45,B51,B54,B56,B85,B90,B92,B96,C12,C25,C31,C47,C54,C61,C84
`Chr2:9987394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:9987441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:9987469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C12

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934884.1
ATGATTAAAGTACATGATGTAGTTAGAGAATTGTGCCTAAAGATTGCCAAGAAAGAGGAGTTTTTATGTGTGTTGGATACTCCACGAGCCATAAACAGGGAGCGCCGAGTTGTAATCAGTGGAGAAATTCCAGAGACAAAAACCTTTGATGCTCCAATCCGTTGTCTGATATGCGAAGGCGGTCGGCTATTGCATGACTTGAAATTGTTGAGAACAGTGCATGAGGTTGCTGCCTCATCAACAACTGACTCTATATTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007977
ATGATTAAAGTACATGATGTAGTTAGAGAATTGTGCCTAAAGATTGCCAAGAAAGAGGAGTTTTTATGTGTGTTGGATACTCCACGAGCCATAAACAGGGAGCGCCGAGTTGTAATCAGTGGAGAAATTCCAGAGACAAAAACCTTTGATGCTCCAATCCGTTGTCTGATATGCGAAGGCGGTCGGCTATTGCATGACTTGAAATTGTTGAGAACAGTGCATGAGGTTGCTGCCTCATCAACAACTGACTCTATATTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790867.1
MIKVHDVVRELCLKIAKKEEFLCVLDTPRAINRERRVVISGEIPETKTFDAPIRCLICEGGRLLHDLKLLRTVHEVAASSTTDSIFQQLNLRYLKVDIDQKSRPSVYLPSSISLLWNLQILRIWVPTHSTVIAPYEIWEMVQLRYFEVYPVCRVDPLPVDRLDQANDLVLRNLHTLSIVENLRFSEEVCKRIPHVREMHLSYCDEASSSYCPSNLGNFHELEYLLLKFDGNSKWHDFCLSLTFPFSLKWLYLRGCGVDWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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