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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000664`

染色体: Chr02 坐标: 10205962-10207458 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000664`
名称	SmilChr02G000664
描述	uncharacterized SmilChr02G000664
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	10205962 - 10207458 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007979`
GeneID	`131007979`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007979`
原始查询	`LOC131007979`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593]; symbol=AT5G45570; hit=AT5G45570; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593]; symbol=AT5G45570; hit=AT5G45570; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G45570` (AT5G45570) Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593] identity=26.9; qcov=0.456; evalue=7.34e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007979

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790869.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790869.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790869.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790869.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:10205984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr2:10205989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C31
`Chr2:10205997`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A10,A15,B100,B120,B138,B41,B44,B5,B51,B54,B61,B63,B71,B72,B83,B91,C11,C21,C29,C52,C70,C74,C86
`Chr2:10206053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C32,C35,D3
`Chr2:10206055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,C60,C85
`Chr2:10206068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B98,C32,C34,C35
`Chr2:10206072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:10206074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C60
`Chr2:10206105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:10206109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:10206123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B134,B98,D4
`Chr2:10206126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,C39,C80,C85,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790869.1

318 aa

159

318

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 147-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790869.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	147	287	1.5e-12	48.5	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934886.1
ATGAGGATGCCATCTGCAGCATGTAAAAGTCCATTCCGGCGTGATGATGTCAGAGGAACAAATTTTCTTAGGTACCTGAGGAGCAAAGAAGCTGAACAGAGGAATGTGGGTTTGCCATATCTGGTGGACAAAAATTGGTTTGGTCTGATAAAGAAGACCACCGAAAAGCTAGACAGTCAAAGCATAGACTCTTACCTTGCCGTGCTAGCAGCAAAACCAGAGTTGGCTGGTTTTGAAGGAATTGAATTCCCTGCAAACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007979
ATGAGGATGCCATCTGCAGCATGTAAAAGTCCATTCCGGCGTGATGATGTCAGAGGAACAAATTTTCTTAGGTACCTGAGGAGCAAAGAAGCTGAACAGAGGAATGTGGGTTTGCCATATCTGGTGGACAAAAATTGGTTTGGTCTGATAAAGAAGACCACCGAAAAGCTAGACAGTCAAAGCATAGACTCTTACCTTGCCGTGCTAGCAGCAAAACCAGAGTTGGCTGGTTTTGAAGGAATTGAATTCCCTGCAAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790869.1
MRMPSAACKSPFRRDDVRGTNFLRYLRSKEAEQRNVGLPYLVDKNWFGLIKKTTEKLDSQSIDSYLAVLAAKPELAGFEGIEFPANIAITGTMFSATIDQVWNELHGKDPKGTTYDPKSEEIIQEEQMKRLCLFAVGKEPRWGEYVKKWNDVEKLIMIVHFNDHWATCLVNFTDHELTIYDSNQHKFDDIHLDIRQCAFLPICRIIPQILKKIGYYEKRNVDGKYTEWIYSYPYDGSNNLKQLDSVSCGVLSIKYVEMML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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