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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002271`

染色体: Chr01 坐标: 39475509-39476317 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002271`
名称	SmilChr01G002271
描述	uncharacterized SmilChr01G002271
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39475509 - 39476317 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007985`
GeneID	`131007985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007985`
原始查询	`LOC131007985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=37.6; qcov=0.727; evalue=2.1e-25; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790876.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790876.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057790876.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790876.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790876.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39475602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:39475611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:39475638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B113,C61
`Chr1:39475683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B13,B93
`Chr1:39475683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B93
`Chr1:39475704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A8,B15,B46,B78,C27,C37,C74
`Chr1:39475750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:39475782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:39475795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:39475807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A3,B113,B25,C61
`Chr1:39475807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B113,B25,C61
`Chr1:39475824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A21,B103,B104,B45,B79,C14,C41,C42,C58,C80,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790876.1

216 aa

108

216

SH3_Tf2-1

PF24626 SH3_Tf2-1 98-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790876.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	98	162	4.6e-20	72.2	Tf2-1-like, SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934893.1
ATGGTATTTCAAAATCCTAAGCAATGGACTTTGTGGCTTTCTCTAGCTGAGCACTGGTATAACACTAATTATCACACAGGGATTAAGATGAGCCCCTTCGAGGCTCTCTATGGTCAACCCCCATCACACCCTTCCCTACTGCTACACTACCCAATCCTAGATGAAGAAGCAAAACAGTTCATCCACACTAGACAACAGCTCTTACAAACACTAAAGGAAAATTTGCAGCAAGCCCAAGCTCGAATGAAAATGTATGCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007985
ATGGTATTTCAAAATCCTAAGCAATGGACTTTGTGGCTTTCTCTAGCTGAGCACTGGTATAACACTAATTATCACACAGGGATTAAGATGAGCCCCTTCGAGGCTCTCTATGGTCAACCCCCATCACACCCTTCCCTACTGCTACACTACCCAATCCTAGATGAAGAAGCAAAACAGTTCATCCACACTAGACAACAGCTCTTACAAACACTAAAGGAAAATTTGCAGCAAGCCCAAGCTCGAATGAAAATGTATGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790876.1
MVFQNPKQWTLWLSLAEHWYNTNYHTGIKMSPFEALYGQPPSHPSLLLHYPILDEEAKQFIHTRQQLLQTLKENLQQAQARMKMYANKGRVEREFTVGDWVYLKLQSYRQQSVALPRNLKLAAHYYGPYQVTGRIGSVAYCLALPEGSRIHPVFHISILKKVLSPAVSPSTELPIVDQDGAFIVTPIAIYGERSILRRGRRVQQKLLLKEVENQGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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