当前解析结果
SmilChr01G002278| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002278 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002278 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002278 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 39547924 - 39548787 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007993 |
|---|---|
| GeneID | 131007993 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007993 |
| 原始查询 | LOC131007993 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G06740 (MUG3)MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=21.4; qcov=1.01; evalue=8.95e-11; confidence=weak |
| Rice | Os12g0597300- identity=27.3; qcov=1.01; evalue=7.51e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007993 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790884.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057790884.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790884.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790884.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790884.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:39547972 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
Chr1:39547991 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B87,C67 |
Chr1:39547991 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B87,C67 |
Chr1:39548006 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr1:39548009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B33,B80,B89,B97,C44 |
Chr1:39548011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C16,C39 |
Chr1:39548036 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr1:39548046 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B55,C57,D11 |
Chr1:39548049 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B55,C57,D11 |
Chr1:39548061 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr1:39548075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B127,B40,B54 |
Chr1:39548096 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C23,C84 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。