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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000715`

染色体: Chr02 坐标: 11516826-11519822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000715`
名称	SmilChr02G000715
描述	uncharacterized SmilChr02G000715
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11516826 - 11519822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007994`
GeneID	`131007994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007994`
原始查询	`LOC131007994`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=33.9; qcov=0.155; evalue=1.4e-17; confidence=weak
Rice	`Os08g0202300` - identity=32; qcov=0.302; evalue=8.43e-37; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790883.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790883.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790883.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790883.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790883.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11516835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C43
`Chr2:11516879`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B108,C26,D6
`Chr2:11516879`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B108,C26,D6
`Chr2:11516907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:11516910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B58,C19
`Chr2:11516911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C71
`Chr2:11516956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A13,A7,B107,B113,B117,B64,C2,C62,C7
`Chr2:11516988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:11517014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B128,C16,C24
`Chr2:11517040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B79,C60,C65
`Chr2:11517068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B41,C26
`Chr2:11517133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A16,B100,B103,B104,B112,B120,B13,B20,B27,B29,B54,B67,B85,B97,C27,C30,C40,C47,C54,C74,C83,C9,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790883.1

839 aa

420

839

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF17919 RT_RNaseH_2 618-714 aa PF17917 RT_RNaseH 642-745 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790883.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	618	714	1.3e-30	106.1	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057790883.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	642	745	6.3e-36	123.4	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934900.1
ATGACAAGAACGGATGAGAAGTTAGAGGCTCAAGCCAAGCAATTGAAAATGCTTGAGATACAAGTGGGACAAATTGCCGAGTCTATAAACAATCAACGCCAACAAGGGCAATTCCCAAGCAACACAATCGTGAATCCTAAGGAGCATTGCAAGGCCATTGCTCTAAGGAGTGGGACAACATATGAAGAGCCCAAGATGCCCGACGAAGAAGATAGAAGTGGTGTTGTGGTTGAAGTTGGAGATGGCAACCCTTCCAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007994
ATGACAAGAACGGATGAGAAGTTAGAGGCTCAAGCCAAGCAATTGAAAATGCTTGAGATACAAGTGGGACAAATTGCCGAGTCTATAAACAATCAACGCCAACAAGGGCAATTCCCAAGCAACACAATCGTGAATCCTAAGGAGCATTGCAAGGCCATTGCTCTAAGGAGTGGGACAACATATGAAGAGCCCAAGATGCCCGACGAAGAAGATAGAAGTGGTGTTGTGGTTGAAGTTGGAGATGGCAACCCTTCCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790883.1
MTRTDEKLEAQAKQLKMLEIQVGQIAESINNQRQQGQFPSNTIVNPKEHCKAIALRSGTTYEEPKMPDEEDRSGVVVEVGDGNPSKEKGDRGKKKEVYVAPPPYCPPIPFPQRHQKKNVENEFSKFLEIFRKVHINIPLVEALKQMPSYAKFLKEVISNKRKMGENETVNLTEECSAVLQRKIPTKIKDPRSFTIPCDIGNDRFGKALCDLGASINLMPLSIFNKLEIGTIKPTTIALQKADRSVSYPKGIVEDVLVKVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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