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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000778`

染色体: Chr02 坐标: 12732393-12734106 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000778`
名称	SmilChr02G000778
描述	uncharacterized SmilChr02G000778
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	12732393 - 12734106 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008011`
GeneID	`131008011`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008011`
原始查询	`LOC131008011`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=31.4; qcov=0.893; evalue=3.47e-24; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=40.6; qcov=0.955; evalue=9.85e-39; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0004803 (transposase activity); GO:0006313 (DNA transposition)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008011

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790898.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057790898.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790898.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790898.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:12732417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B33,D10
`Chr2:12732422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B93,C15,C22
`Chr2:12732428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C22
`Chr2:12732431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B33,D10
`Chr2:12732496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr2:12732546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B95
`Chr2:12732546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:12732553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:12732565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B84,C49
`Chr2:12732587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr2:12732725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B140,D10
`Chr2:12732753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790898.1

178 aa

178

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 31-127 aa PF00872 Transposase_mut 50-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790898.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	31	127	5.7e-17	62.6	MULE transposase domain
`XP_057790898.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	50	131	1.2e-05	25.2	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934915.1
GATTTTTGAGCGTATTAAGAAACATTATTCTGAGTTAGGGTTCCCAAATCCTAAAGGGATATATATTTATGACACTGATAAGAATTTTGAAGAGGGTTTGTATCTAATTAAGGATGAAGAGTCCTGTAGAAAGACTTTACAGTATATGAAAATAGTGAATGAGAATAAAATTGAATTCTTTATTGATGATGATGAGATGCCTCTGCCGGTTAGTTTAGTGCCTAGTATTTTACCGACTGAAGTGGTGAATTGTGGTAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008011
ATGTCATCAGAAGATGGTAAGCGCATTTTTAGAAGAGCCTTTATAATGATGGATGCTTGCAAGAGGAATTGGATGGGTGGTTGTAGACCCATCATCTGTTTAGATGGATGTCATTTGAAAGGAGTTTGCCCTGGCATGCTACTTACAGCAGTAGGAAAAGATGCAACTGACCAAATTGTTCCAATTGCATGGGCAATCATTGGCAAAGAGAACAAAGTGAATTGGAGGTGGTTTCTCTGTTGGTTGAAGCAAGAGTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790898.1
MSSEDGKRIFRRAFIMMDACKRNWMGGCRPIICLDGCHLKGVCPGMLLTAVGKDATDQIVPIAWAIIGKENKVNWRWFLCWLKQELELDDGARLTVMSDMQKGLLDAVNNTLPNAEHRWCARHIYANWSKKWRGDELKKRFWICAWSTFEEEFKANLSRIGEIHKQAAEGLLKYPVHM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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