当前解析结果
SmilChr02G000819| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000819 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000819 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000819 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 13793998 - 13794387 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008024 |
|---|---|
| GeneID | 131008024 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008024 |
| 原始查询 | LOC131008024 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os08g0315200- identity=37.5; qcov=0.992; evalue=4.25e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008024 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057790910.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790910.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057790910.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790910.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790910.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:13794006 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr2:13794008 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B117 |
Chr2:13794015 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | A16,A22,B113,B20,B37,B6,B88,B96,C34,C62,C63,C64,C66,C80,C81 |
Chr2:13794027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,C16 |
Chr2:13794042 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 26 | A20,A3,B104,B106,B114,B12,B129,B137,B139,B15,B16,B24,B27,B47,B55,B57,B63,B82,C13,C2,C20,C46,C60,C61,D10,D7 |
Chr2:13794043 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr2:13794054 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr2:13794064 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B2,B48,C1,C29 |
Chr2:13794081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B71,C20,C68 |
Chr2:13794093 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C61,C8 |
Chr2:13794093 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C61,C8 |
Chr2:13794121 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。