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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000821`

染色体: Chr02 坐标: 13833774-13835877 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000821`
名称	SmilChr02G000821
描述	uncharacterized SmilChr02G000821
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	13833774 - 13835877 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008025`
GeneID	`131008025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008025`
原始查询	`LOC131008025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G08267` (AT4G08267) hAT transposon superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3770340] identity=48.5; qcov=0.225; evalue=2.89e-24; confidence=weak
Rice	`Os06g0658400` - identity=53.1; qcov=0.884; evalue=5.28e-134; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790912.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790912.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790912.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790912.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790912.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:13833777`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B50,B66,C8
`Chr2:13833777`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B50,B66,C8
`Chr2:13833891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr2:13833950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B66,C8
`Chr2:13833981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,B98,C62
`Chr2:13834012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:13834124`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B117,C74
`Chr2:13834124`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B117,C74
`Chr2:13834136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A23,B42,C28
`Chr2:13834136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B42,C28
`Chr2:13834329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C69
`Chr2:13834334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790912.1

432 aa

216

432

DUF659

PF04937 DUF659 94-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790912.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	94	173	1.1e-23	84.2	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934929.1
ATGATTTTAGAGCTAGGAAAAGCTTTCAATGCACAAGCTCGTGAGATATTAGATGGTGAGATTGCAAGGATGTTCTACTTAGCTGGGCTTCCTTTTAACCTCGCTAAAAATCCACACTTTATTAAGTCTTACAGTTTGGCTGCCAATAGTAATGTTGCAGGTTATAACCCTCCAAGTTACAATGCACTAAGAACCAAATTATTGAAAAATGAGAGGTCACATCTTCAAACTTTGCTTGAAGCTACTAAAAGCACATGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008025
ATGATTTTAGAGCTAGGAAAAGCTTTCAATGCACAAGCTCGTGAGATATTAGATGGTGAGATTGCAAGGATGTTCTACTTAGCTGGGCTTCCTTTTAACCTCGCTAAAAATCCACACTTTATTAAGTCTTACAGTTTGGCTGCCAATAGTAATGTTGCAGGTTATAACCCTCCAAGTTACAATGCACTAAGAACCAAATTATTGAAAAATGAGAGGTCACATCTTCAAACTTTGCTTGAAGCTACTAAAAGCACATGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790912.1
MILELGKAFNAQAREILDGEIARMFYLAGLPFNLAKNPHFIKSYSLAANSNVAGYNPPSYNALRTKLLKNERSHLQTLLEATKSTWKSKGVTIDVITEVGVPNVVQVITDNAPVCKAAGMLVEQAYPSVFWTPCVVHTLNLALKNICAAKNTESNEITYAECRWISEIAASAIMIRNFIMNLSMRLAMFTEFSKLKLLVVAETRFASMIIMLKRFRDVKCQLQSMVISEQWSMYREDNIEKARIVKEKLLDDGWWDSVGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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