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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000843`

染色体: Chr02 坐标: 14328036-14329067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000843`
名称	SmilChr02G000843
描述	uncharacterized SmilChr02G000843
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	14328036 - 14329067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008026`
GeneID	`131008026`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008026`
原始查询	`LOC131008026`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=28.5; qcov=0.599; evalue=2.68e-15; confidence=low
Rice	`Os09g0268600` - identity=39.3; qcov=0.666; evalue=2.26e-36; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008026

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790913.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790913.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790913.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790913.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790913.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:14328124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C14
`Chr2:14328181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr2:14328247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr2:14328268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B10,B109,B112,B14,B2,B38,B44,B74,C22,C25,C29,C54,C79,D3
`Chr2:14328278`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr2:14328278`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr2:14328304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B37,C43,C80
`Chr2:14328307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B16,B95,C33,C54
`Chr2:14328317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B100,B90,C20,D6
`Chr2:14328323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,C33,C82,D11
`Chr2:14328356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B76,C87
`Chr2:14328363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A21,A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790913.1

287 aa

144

287

SWIM

PF04434 SWIM 65-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790913.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	65	92	2.4e-08	34.0	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934930.1
ATGTTGGAAGCAGTTAGAAGTGGCCTTAGGGAGAGACAATTTCAGAAGTTAAAACATGTTGAAAGTGTGTCTGATGTGTTAACACCTGCTGTTAGAAAAAAAGTTGAAAAATTGAAGAGTTTGGCTAGGTTCTGTACAGCTCACCCTGGGCTAGGGGGTAAGTTTGAGGTTGAGAACAAGGATGATAGATTCATAGTTTCTTTACCTGAAAGAAACTGCAGCTGTAGAGTTTGGGAGCTCACTGGCATTCCATGTATCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008026
ATGTTGGAAGCAGTTAGAAGTGGCCTTAGGGAGAGACAATTTCAGAAGTTAAAACATGTTGAAAGTGTGTCTGATGTGTTAACACCTGCTGTTAGAAAAAAAGTTGAAAAATTGAAGAGTTTGGCTAGGTTCTGTACAGCTCACCCTGGGCTAGGGGGTAAGTTTGAGGTTGAGAACAAGGATGATAGATTCATAGTTTCTTTACCTGAAAGAAACTGCAGCTGTAGAGTTTGGGAGCTCACTGGCATTCCATGTATCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790913.1
MLEAVRSGLRERQFQKLKHVESVSDVLTPAVRKKVEKLKSLARFCTAHPGLGGKFEVENKDDRFIVSLPERNCSCRVWELTGIPCIHAISAIHFMKEDPANYVHKYLTTETYLKAYSYPLEPINGERQWPKAVGYPVQPPQVRVMPGRPKKKRRRDQDEKDPKNPSRLTRAGTVMTCQNCFQLGHNSRGCKNETVEKEKPEKRKPGRPRKHPMPDDDVNSGGASKSKKKSKSKTLAMERAQASKGVGHFVGEETGNSYIC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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