当前解析结果
SmilChr02G000856| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000856 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000856 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000856 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 14605342 - 14605797 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008030 |
|---|---|
| GeneID | 131008030 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008030 |
| 原始查询 | LOC131008030 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008030 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057790917.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057790917.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057790917.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790917.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790917.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:14605354 |
G |
GTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B93,C23,C74 |
Chr2:14605354 |
G |
GTC |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | B93,C23,C74 |
Chr2:14605361 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B93,C23,C74 |
Chr2:14605362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,B63 |
Chr2:14605386 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,C23 |
Chr2:14605422 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B48,B65 |
Chr2:14605450 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B43,B48,B65,C74,D3 |
Chr2:14605450 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B43,B48,B65,C74,D3 |
Chr2:14605458 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B38,B72,C11,C65,C69 |
Chr2:14605476 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,C15 |
Chr2:14605478 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:14605489 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B19,C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。