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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000876`

染色体: Chr02 坐标: 15080626-15081378 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000876`
名称	SmilChr02G000876
描述	uncharacterized SmilChr02G000876
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	15080626 - 15081378 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008040`
GeneID	`131008040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008040`
原始查询	`LOC131008040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790926.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790926.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790926.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057790926.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790926.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:15080641`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B11,B114,B88,C37
`Chr2:15080641`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B11,B114,B88,C37
`Chr2:15080652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr2:15080715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B93,C12,C59
`Chr2:15080726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B2,C78,D5
`Chr2:15080767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B50
`Chr2:15080799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr2:15080848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B27,C69,D7
`Chr2:15080849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C3,C69
`Chr2:15080865`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	B107,B109,B122,B128,B13,B16,B17,B18,B31,B32,B33,B40,B54,B60,C36,C45,C48,D6,D7
`Chr2:15080905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B90,C11,C51,C74
`Chr2:15080913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790926.1

250 aa

125

250

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 39-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790926.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	39	108	4.4e-10	40.5	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934943.1
ATGGGAACGGTCAAAGACAAGTTCGAAGGGACCTCGAAATCAGCATGGACTTATAGCAAGCCATATACTACAAGGATTGACTCATTGAAGATGCCAATAGGCTACCAGCCTCCAAAGTTTCAACAATTTGATGGCAAAGGCAATCCAAAGCAACATGTGGCTCACTTTATGGAGACATGCAATGATGCGGGAACATATGGAGATTACTTGGTGAAGCAATTTGTTCGTTCCTTGAAAGACAATGCATTTGATTGGTATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008040
ATGGGAACGGTCAAAGACAAGTTCGAAGGGACCTCGAAATCAGCATGGACTTATAGCAAGCCATATACTACAAGGATTGACTCATTGAAGATGCCAATAGGCTACCAGCCTCCAAAGTTTCAACAATTTGATGGCAAAGGCAATCCAAAGCAACATGTGGCTCACTTTATGGAGACATGCAATGATGCGGGAACATATGGAGATTACTTGGTGAAGCAATTTGTTCGTTCCTTGAAAGACAATGCATTTGATTGGTATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790926.1
MGTVKDKFEGTSKSAWTYSKPYTTRIDSLKMPIGYQPPKFQQFDGKGNPKQHVAHFMETCNDAGTYGDYLVKQFVRSLKDNAFDWYVNLEPNSIDSWGQMQKEFLNRFYSTRRTVSIVELTNAKQWKEESVIDYINRWRDLSLNCKDRLSEASAIEMCIQGMHWSLQYILKGIRPNTFEELTTRAHDMELSMIANKVDDLHMQMADDFQEDEEASHGGKSLEEIPSEDDEEIPSEDDEETSNVTTNQSSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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