当前解析结果
SmilChr01G000281| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000281 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000281 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000281 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 5521374 - 5522027 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008060 |
|---|---|
| GeneID | 131008060 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008060 |
| 原始查询 | LOC131008060 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008060 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790966.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057790966.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057790966.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057790966.1 |
| 5 | Nuclear speckle | 核斑点 | 0.20000 | XP_057790966.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:5521395 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr1:5521458 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr1:5521466 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A20,B121,B25,B5,B51,B72,C17,C27 |
Chr1:5521485 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr1:5521500 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B27,C43,D8 |
Chr1:5521503 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:5521507 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B5,B51,B72,C17,C32,C59 |
Chr1:5521515 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C60 |
Chr1:5521522 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A11 |
Chr1:5521534 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,B29,B41,B49,B50 |
Chr1:5521553 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr1:5521562 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B9,C15,C31,C38,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。