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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001048`

染色体: Chr02 坐标: 18541090-18542998 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001048`
名称	SmilChr02G001048
描述	uncharacterized SmilChr02G001048
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	18541090 - 18542998 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008091`
GeneID	`131008091`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008091`
原始查询	`LOC131008091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=26.9; qcov=0.162; evalue=1.52e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008091

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790974.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790974.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790974.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790974.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790974.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:18541899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C56
`Chr2:18541959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:18541966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:18541976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:18541992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B67
`Chr2:18542024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C78
`Chr2:18542047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C38
`Chr2:18542049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B125,C16,C54
`Chr2:18542052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B74,C8
`Chr2:18542063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B67,C16
`Chr2:18542067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B101,C16
`Chr2:18542080`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B82,C37,C78,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790974.1

574 aa

287

574

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 208-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790974.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	208	298	1.5e-06	29.5	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934991.1
ATGACAAAGCAGAGCATGGAGTCCCAGTCGGCTACAATCAAGCGTCTCGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAATCAGATGCAGCAGCAGCAGCAACAACCAGGGAAGCTACATGGACAAGGATTGCAACCCCACCAAGCCCAAGCAGTTACTGTTTTACGCAATGGGAAGGTGGTGAACAACAAAGTGGAAACCCCTGTAGAAGAACCCCCCAAAGAAGGCCGCATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008091
ATGACAAAGCAGAGCATGGAGTCCCAGTCGGCTACAATCAAGCGTCTCGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAATCAGATGCAGCAGCAGCAGCAACAACCAGGGAAGCTACATGGACAAGGATTGCAACCCCACCAAGCCCAAGCAGTTACTGTTTTACGCAATGGGAAGGTGGTGAACAACAAAGTGGAAACCCCTGTAGAAGAACCCCCCAAAGAAGGCCGCATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790974.1
MTKQSMESQSATIKRLETTVGQLSGTLNQMQQQQQQPGKLHGQGLQPHQAQAVTVLRNGKVVNNKVETPVEEPPKEGRMEEQVKEPLQPREEEKEKEKEPEVKLHKAAKPYKPPVPYPSRLKNEKLDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLDVIRNVPAYVKFFKELASKKRKFVDNEKILVSEVANSIMQQPLPPKQRDPGSFVINIALGNGKEASGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGDLKPTRMCLQLADRSVRYPRGVIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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