当前解析结果
SmilChr02G001094| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001094 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001094 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001094 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 19735577 - 19737694 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008104 |
|---|---|
| GeneID | 131008104 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008104 |
| 原始查询 | LOC131008104 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008104 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790986.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790986.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057790986.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790986.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790986.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:19735578 |
CAA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C4 |
Chr2:19735578 |
CAA |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr2:19735600 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B99,C73,C80,C87 |
Chr2:19735600 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B99,C73,C80,C87 |
Chr2:19735617 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 32 | A5,B100,B109,B115,B122,B126,B131,B17,B2,B3,B33,B34,B41,B46,B54,B61,B7,B70,B73,B78,B80,B83,C15,C2,C33,C45,C60,C61,C65,C72,C79,C9 |
Chr2:19737159 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
Chr2:19737179 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,C27,C44,D3 |
Chr2:19737193 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C8 |
Chr2:19737193 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr2:19737198 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A24,B14,B37,B43,B71,B72,B95,C34,C37,C50 |
Chr2:19737200 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B52,B53,C29 |
Chr2:19737202 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,C27,C44,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。