当前解析结果
SmilChr02G001107| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001107 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001107 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001107 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 19955708 - 19956406 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008109 |
|---|---|
| GeneID | 131008109 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008109 |
| 原始查询 | LOC131008109 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008109 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057790990.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790990.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057790990.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057790990.1 |
| 5 | Acrosome | Acrosome | 0.40000 | XP_057790990.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:19955713 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 45 | A10,A2,A20,B1,B103,B105,B113,B114,B121,B122,B123,B136,B139,B17,B20,B21,B22,B24,B47,B49,B51,B6,B60,B64,B78,B79,B8,B86,B87,B94,C16,C18,C19,C23,C36,C37,C39,C4,C52,C55,C57,C61,C65,C67,C75 |
Chr2:19955715 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 95 | A10,A16,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A4,A5,B1,B10,B101,B103,B105,B107,B109,B11,B113,B114,B117,B118,B121,B122,B123,B129,B130,B131,B136,B138,B139,B17,B20,B21,B22,B24,B29,B31,B38,B42,B45,B47,B48,B49,B51,B56,B57,B6,B60,B64,B65,B7,B70,B72,B74,B77,B78,B79,B8,B86,B87,B94,C1,C12,C14,C16,C18,C19,C23,C24,C25,C26,C36,C37,C39,C4,C42,C43,C47,C50,C51,C52,C55,C56,C57,C6,C61,C65,C67,C69,C75,C77,C8,C81 |
Chr2:19955733 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B39,B44 |
Chr2:19955733 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B39,B44 |
Chr2:19955749 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,B26,C55 |
Chr2:19955760 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 19 | A13,A15,B119,B138,B40,B52,B87,B90,B92,C2,C21,C28,C32,C40,C68,C7,C73,C87,D9 |
Chr2:19955763 |
T |
TCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 26 | B102,B13,B140,B23,B30,B48,B53,B67,B7,B81,B9,B99,C10,C15,C16,C19,C2,C37,C46,C52,C53,C64,C72,C80,C82,D2 |
Chr2:19955766 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 25 | B102,B13,B140,B23,B30,B48,B53,B67,B7,B81,B9,B99,C10,C15,C16,C19,C2,C37,C52,C53,C64,C72,C80,C82,D2 |
Chr2:19955795 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr2:19955799 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,B64,B83,D11 |
Chr2:19955823 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B107,B35,B57,C1 |
Chr2:19955833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。