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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001249`

染色体: Chr02 坐标: 22963477-22964250 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001249`
名称	SmilChr02G001249
描述	uncharacterized SmilChr02G001249
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22963477 - 22964250 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008146`
GeneID	`131008146`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008146`
原始查询	`LOC131008146`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=36.1; qcov=0.658; evalue=2.34e-26; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008146

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791023.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791023.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791023.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791023.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22963479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B124,B16,C67
`Chr2:22963486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B101,B11,B17,B51,B78,C18,C70
`Chr2:22963499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B124,B16,C67
`Chr2:22963508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C2
`Chr2:22963509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B124,B16,C29,C67
`Chr2:22963516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C41,C62
`Chr2:22963538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr2:22963541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:22963544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C56,C63,C65,C82,D5
`Chr2:22963547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B37,B51,B80,B81
`Chr2:22963552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,D7
`Chr2:22963588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A16,B14,B24,B28,B31,B40,B53,B7,B72,B73,B97,C17,C19,C30,C32,C38,C46,C51,C66,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791023.1

257 aa

128

257

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 37-198 aa PF03732 PEG10_N-capsid 39-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791023.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	37	198	1.6e-09	38.2	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057791023.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	39	117	2.9e-10	41.0	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935040.1
ATGCCTCCACGAAAAGTGTACAGAAATGTACCCGTGAATGAGGAAGAACCCAGAGAACCTACGCCGCCACCCCCACCTCAAGATAGGAGGGTGGAAGAACTTTTCTTAAGACAGAACCCACCGACTTTCGCAGGCACGGGAGACCCTGCCGAAACGGAAGAATGGATTCGTGCTATGGAACGAATCTTTCGATTTTTGAGATGCAACGACGCAGAACGTCTTATGTGCATGTCTTACCAGCTGAAAGGAACCGCCGACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008146
ATGCCTCCACGAAAAGTGTACAGAAATGTACCCGTGAATGAGGAAGAACCCAGAGAACCTACGCCGCCACCCCCACCTCAAGATAGGAGGGTGGAAGAACTTTTCTTAAGACAGAACCCACCGACTTTCGCAGGCACGGGAGACCCTGCCGAAACGGAAGAATGGATTCGTGCTATGGAACGAATCTTTCGATTTTTGAGATGCAACGACGCAGAACGTCTTATGTGCATGTCTTACCAGCTGAAAGGAACCGCCGACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791023.1
MPPRKVYRNVPVNEEEPREPTPPPPPQDRRVEELFLRQNPPTFAGTGDPAETEEWIRAMERIFRFLRCNDAERLMCMSYQLKGTADYWWEAKQKTMAPEQLDELTWDLFKIALCEKFIPRSYRKKKEMEFTTLKQGNKTVVEYDRLFCDLARYAPYRVDTDEKMSELFCAGLRQEIRVVLASQTALSYAEALNRALDMELAMQPEKAAHAPVPPSAQYTQASNTPYSNQGQKRKRKWENRGMRVKSHGKARMFSLHS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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