当前解析结果
SmilChr02G001308| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001308 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001308 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001308 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 24321407 - 24321957 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008169 |
|---|---|
| GeneID | 131008169 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008169 |
| 原始查询 | LOC131008169 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008169 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791046.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057791046.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791046.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791046.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791046.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:24321407 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr2:24321527 |
TCA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A10,C86 |
Chr2:24321527 |
TCA |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | A10,C86 |
Chr2:24321605 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr2:24321607 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B106,B61,C7,C71,D3 |
Chr2:24321627 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:24321628 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B23,B24,B3,B78,C32,C68,D9 |
Chr2:24321638 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,B92 |
Chr2:24321654 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B95,C32,C68 |
Chr2:24321675 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B95,C32,C68 |
Chr2:24321729 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A21,B122,B60,C85 |
Chr2:24321747 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 79 | A10,A11,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A3,A4,A7,A9,B10,B101,B109,B11,B111,B113,B115,B12,B120,B127,B130,B132,B133,B138,B20,B21,B22,B23,B28,B30,B37,B42,B43,B48,B56,B57,B58,B60,B62,B74,B78,B79,B80,B88,B90,B92,B93,B94,B96,B97,C13,C18,C19,C24,C29,C31,C32,C34,C38,C40,C42,C43,C44,C49,C57,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C81,C83,C86,D3,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。