当前解析结果
SmilChr02G001320| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001320 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001320 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001320 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 24544784 - 24546737 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008173 |
|---|---|
| GeneID | 131008173 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008173 |
| 原始查询 | LOC131008173 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=35.3; qcov=0.358; evalue=6.76e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008173 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791050.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057791050.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057791050.1 |
| 4 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057791050.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791050.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:24544836 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B119,B17,C40,C87 |
Chr2:24545227 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,D1 |
Chr2:24545232 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,D1 |
Chr2:24545233 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,D1 |
Chr2:24545248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,D1 |
Chr2:24545277 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,C52,D1 |
Chr2:24545290 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:24545291 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr2:24545292 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,D1 |
Chr2:24545295 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,D1 |
Chr2:24545298 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr2:24545314 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 38 | A18,A3,A7,B104,B11,B123,B125,B13,B133,B136,B140,B17,B29,B36,B47,B50,B51,B52,B57,B6,B87,B88,B94,B95,B97,C14,C17,C18,C3,C31,C39,C51,C65,C71,C77,C81,C84,C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。